مکان یابی QTL های کنترل کننده تحمل به سرما در برنج

به منظور شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با تحمل به دماهای پایین در برنج، یک جمعیت F۲ متشکل از ۱۲۴ بوته حاصل از تلاقی لاین PR۲۷۱۳۷-CR۱۵۳ (متحمل به سرما) و رقم دمسیاه (حساس به سرما) مورد ارزیابی قرار گرفت. نقشه پیوستگی با استفاده از ۲۰ نشانگر SSR و ۸۱ نشانگر چندشکل AFLP تشکیل شد و در مجموع ۳۱۱۱ سانتی­مورگان از ژنوم برنج را با متوسط فاصله ۳۱.۶۷ سانتی مورگان تحت پوشش قرار داد. برای شناسایی ­QTLها از روش مکان یابی فاصله ای مرکب استفاده شد که در مجموع تعداد ۱۳ فاصله نشانگری واجد QTL برای ۴ صفت تحمل به پژمردگی (CIWT)، تحمل به نکروزه شدن (CINT)، تحمل به زرد شدن (CIYT) و تحمل به سرما (CT) مکان یابی شدند. از این تعداد، سه جایگاه QTL برای صفت CIWT روی کروموزوم های ۲، ۸ و ۱۲، پنج جایگاهQTL  برای صفت CINT روی کروموزوم های ۱، ۳، ۳، ۱۰ و ۱۲، سه جایگاه QTL مربوط به صفت CIYT روی کروموزم­های ۱، ۲ و ۸ و دو جایگاه QTL برای صفت CT روی کروموزوم های ۳ و ۱۲ مکان­یابی شدند. در این تحقیق دو QTL بزرگ اثر qCIWT۱۲ و qCINT۱۲ روی کروموزوم ۱۲ و در مجاورت نشانگرهای RM۷۲۰۰ و E۶۴-M۵۹-۵ شناسایی شدند که سهم قابل توجهی از واریانس فنوتیپی را بیان کردند.