تجزیه و تحلیل ساختار کامل ناحیه دی لوپ میتوکندریایی به همراه موتیف های تنظیمی در ۴ گونه ماهیان خاویاری دریای خزر

در این پژوهش قطعه کامل دی لوپ به همراه موتیف های تنظیمی آن در چهار گونه از ماهیان خاویاری دریای خزراز جنس Acipenser (چالباش A.Gueldenstadtii، قره برون A.persicus، شیپ A.nudiventris، اوزون برون A.stellatus) مورد بررسی قرار گرفت. استخراج  DNAبا استفاده از روش استات آمونیوم و واکنش PCR توسط یک جفت آغازگر اختصاصی جهت  تکثیر ناحیه کامل دی لوپ انجام گرفت. توالی یابی با استفاده از روش سنگر انجام شد. توالی تکراری مینی ستلایت در ناحیه بالادست دی لوپ و بعد از توالی کدکننده تی آر ان آ پرولین در همه گونه ها به جز شیپ مشاهده شد. نتایج نشان داد که واحدهای تکراری مرکزی ۸۳-۸۲ جفت بازی با ۲/۳ تکرار در چالباش و قره برون و ۴/۲ تکرار در اوزون برون سبب تنوع طول در این ناحیه شده است. علاوه بر این، توالی تکراری مرکزی، دو توالی تکراری دیگر با اندازه ۳۹ و ۴۳  جفت باز نیز در این بخش مشاهده شد  که این توالی ها نیز با ۲/۳  تکرار در این ناحیه وجود داشتند. طول ناحیه کنترلی در گونه های چالباش، قره برون، اوزون برون و شیپ به ترتیب برابر با ۹۲۱، ۸۷۰، ۸۲۶ و ۸۳۹ جفت باز بود. بررسی ساختار کلی ناحیه دی لوپ نشان داد که ناحیه کنترلی  ماهیان خاویاری شامل همولوگ هایی از بلوک های توالی محافظت شده CSB می باشد که واحد های تکراری مینی ستلایت در بالادست این بلوک ها واقع شده اند. حضور توالی های تکراری مینی ستلایت در ناحیه کنترلی دی لوپ اهمیت این نشانگرها را در برنامه های حفظ منابع ژنتیکی و غربالگری ماهیان خاویاری نشان می دهد.