ISSR Analysis for Determination of genetic diversity in ۲۹ olive (Olea europaea L.) cultivars

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 147

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJGPB-7-1_004

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1400

چکیده مقاله:

Olive tree is one of the most important oleaginous crops in the world, and known for having large genetic variability. Application of molecular markers is a suitable tool to investigate the genetic pool in crops. Therefore, in the current study ۲۹ olive cultivars were tested by ten primers constituted by inter simple sequence repeats (ISSR). Plant materials were obtained from the collection of Tarom Agricultural Research Center in ۲۰۱۵. Genomic DNA was extracted from fresh leaves of ۲۹ cultivars by a modified CTAB method. Ten ISSR primers were used and obtained data were scored. An analysis of primer informativeness showed that all primers were productive and effective in separating olive cultivars. Nevertheless, some of them were more effective such as UBC ۸۵۵ and UBC ۸۲۵ primers. According to cluster analysis and genetic distance, the olive cultivars were separated into three major clusters. Majority of the cultivars from southern and central Mediterranean such as; Italian, Spanish and Grecian olive cultivars clustered in one group. Results of the current study suggest that Mediterranean olive germplasm were structured into two main gene pools, which strongly matched two distinct geographic areas, i.e. western and central as well as eastern Mediterranean regions.

کلیدواژه ها:

Cluster analysis ، Genetic distance ، Inter simple sequence repeats ، Olive

نویسندگان

علیرضا قنبری

Department of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, P. O. Box: ۵۶۱۹۹-۱۱۳۶۷, Ardebil, Iran

اصغر استاجی

Department of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Mohaghegh Ardabili, P. O. Box: ۵۶۱۹۹-۱۱۳۶۷, Ardebil, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alba V., Montemurro C., Sabetta W., pasqualone A., and Blanco, ...
  • Baali-Cherif D., and Besnard G. (۲۰۰۵). High genetic diversity and ...
  • Baldoni L., and Belaj A. (۲۰۱۰). Olive. Handbook of Plant ...
  • Bartolini, G., Prevost G., Messeri C., and Carignani G. (۲۰۰۵). ...
  • Belaj A., Satovic Z., Cipriani G., Baldoni L., Testolin R., ...
  • Besnard G., and Berville A. (۲۰۰۲). On chloroplast DNA variations ...
  • Besnard G., Baradat P., and Berville A. (۲۰۰۱). Genetic relationships ...
  • Besnard G., Khadari B., Baradat P., and Bervillé A. (۲۰۰۲b) ...
  • Besnard G., Khadari B., Villemur P., and Bervillé, A. (۲۰۰۱). ...
  • Besnard G., Rubio de Casas R., and Vargas P. (۲۰۰۷). ...
  • Brake M., Migdadi H., Al-Gharaibeh M., Ayoub S., Haddad N., ...
  • Do Val A. D. B., Ferreira J. L., VieriraNeto J., ...
  • Erre P., Chessa I., Munoz-Diez C., Belaj A., Rallo L., ...
  • Essadki M., Ouazzani O., Lumaret R., and Moumni M. (۲۰۰۶). ...
  • Esselman E. J., Li J. Q., Crawford D., Winduss J. ...
  • Gemas, V. J. V., Almadanim M. C., Tenreiro R., Martins ...
  • Gomes S., Martins-Lopes P., Lima-Brito J., Meirinhos J., Lopes J., ...
  • Gomes S., Martins-Lopes P., Lopes J., and Guedes-Pinto H. (۲۰۰۹). ...
  • Guerin J., and Sedgley M. (۲۰۰۷). Cross-pollination in Olive Cultivars. ...
  • Hakim I. R., Kammoun N. G., Makhloufi E., and Rebai ...
  • Hess J., Kadereit J. W., and Vargas P. (۲۰۰۰). The ...
  • Karp A., Kresovich S., Bhat K. V., Ayada W. G., ...
  • Kayis S. A., Hakki E. E., and Pinarkara E. (۲۰۱۰). ...
  • Kiristsakis P. (۱۹۹۸). Olive Oil. From the Tree to the ...
  • Linos A., Nikoloudakis N., Katsiotis A., and Hagidimitriou M. (۲۰۱۴). ...
  • Lopes M. S., Mendoca D., Sefc K. M., Sabino F., ...
  • Lowe A., Harris S., and Ashton P. (۲۰۰۴). Ecological genetics: ...
  • Lumaret R., Ouazzani N., Michaud H., Vivier G., Deguilloux M. ...
  • Martins-Lopes P., Gomes S, Lima-Brito J., Lopes J., and Guedes-Pinto ...
  • Martins-Lopes P., Lima-Brito J., Gomes S., Meirinhos J., Santos L., ...
  • Nei M. (۱۹۷۳). Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Pasqualone A., Caponio F. and Blanco A. (۲۰۰۱). Inter-simple sequence ...
  • Perrier X., and Jacquemoud-Collet J. P. (۲۰۰۶). Darwin software, http://darwin.cirad.fr/darwin ...
  • Prevost A., and Wilkinson M. J.(۱۹۹۹). A new system of ...
  • Pritchard J. K., Stephens M., and Donnelly P. (۲۰۰۰). Inference ...
  • Rallo P., Dorado G., and Martín A. (۲۰۰۰). Development of ...
  • Reddy P. M., Sarla N., and Siddiq E. A. (۲۰۰۲). ...
  • Roldán-Ruiz I., Dendauw J., Van Bockstaele E., and Depicker A. ...
  • Saitou N., and Nei M. (۱۹۸۷).The neighbor-joining method: a new ...
  • Sarri, V., Baldoni L., Porceddu A., Cultrera N. G. M., ...
  • Shannon C. E., and Weaver W. (۱۹۴۹). The Mathematical Theory ...
  • Terzopoulos P. J., Kolano B., Bebeli P. J., Kaltsikes P. ...
  • Thimmappaiah G., Santhosh W. G., Shobha D., and Melwyn G. ...
  • Vargas P., and Kadereit J. W. (۲۰۰۱). Molecular fingerprinting evidence ...
  • Varshney R. K., Chabane K., Hendre P. S., Aggarwal R. ...
  • Yeh F. C., Yang R. C., and Boyle T. (۱۹۹۹). ...
  • Zohary D., and Spiegel-Roy P. (۱۹۷۵). Beginning of fruit growing ...
  • نمایش کامل مراجع