شناسایی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایه های ویروس کوتولگی زرد پیاز (Onion yellow dwarf virus) در برخی از مناطق کشت سیر در ایران
محل انتشار: فصلنامه حفاظت گیاهان، دوره: 34، شماره: 4
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 203
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JPP-34-4_001
تاریخ نمایه سازی: 14 دی 1400
چکیده مقاله:
ویروس کوتولگی زرد پیاز (Onion yellow dwarf virus, OYDV)، یک پوتی ویروس مهم و خسارت زا در سیر بوده که باعث ظهور رگه های کلروتیک خفیف تا زرد روشن در برگ های آلوده می شود. به دنبال گسترش علائم، کاهش رشد و اندازه قپه های سیر نیز رخ می دهد، اما به طور کلی اصلی ترین علامت آلودگی OYDV هم در سیر و هم در پیاز وقوع کوتولگی در میزبان آلوده است. به منظور شناسایی و تعیین برخی از خصوصیات مولکولی و بیولوژیکی OYDV در کشور، در سال های ۱۳۹۷-۱۳۹۶ تعداد ۶۸ نمونه برگی مشکوک به آلودگی از مزارع سیر در استان های خراسان رضوی، مازندران، لرستان، کرمان و خوزستان جمع آوری شد. در واکنش زنجیره ای پلیمراز با انجام نسخه برداری معکوس (Reverse Transcription-PCR, RT-PCR) با استفاده از یک جفت آغازگر دژنره مربوط به ژن CI، قطعه ۷۰۰ جفت بازی در ۵۴ نمونه تکثیر شد. جهت انجام آنالیز ژنومی و تعیین روابط فیلوژنتیکی در جدایه های ایرانی، تعداد ۷ نمونه برگی دارای علائم مشخص بیماری به عنوان نماینده از هریک از مناطق نمونه برداری انتخاب شدند. این جدایه ها پس از همسانه سازی در ناقل pTG۱۹-T، به شرکت ماکروژن کره جنوبی جهت توالی یابی ارسال شدند. مقایسه نتایج توالی یابی جدایه های ایرانی با سایر جدایه های موجود در بانک ژن، نشان دهنده درصد تشابه نوکلئوتیدی جدایه های ایرانی OYDV با یکدیگر و با سایر جدایه های موجود در بانک ژن به ترتیب (۴۴/۹۴ - ۸۹/۷۹) و (۸۶/۹۹-۰۴/۷۵) بود. همچنین دندروگرام حاصل از مطالعه تبارزایی بر اساس ژن CI، جدایه های ایرانی را در دو گروه مجزا از هم نشان داد. بررسی وقوع نوترکیبی در میان جدایه های ایرانی نشان دهنده عدم وجود هر گونه نوترکیبی در این ناحیه از ژن CI بود. لازم به ذکر است این پژوهش اولین گزارش از وجود OYDV در برخی از مناطق عمده کشت سیر در ایران، بر اساس ژن CI ویروسی می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
آزاده انتظاری
دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
محسن مهرور
دانشیار، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
محمد زکی عقل
دانشیار، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :