DNA barcoding of Nereididae polychaetes based on COI gene barcoding in intertidal shores of Bushehr and Bandar Abbas provinces, Iran

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 259

فایل این مقاله در 21 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JIFRO-19-3_013

تاریخ نمایه سازی: 27 بهمن 1400

چکیده مقاله:

Although polychaetes are the most abundant organisms in marine ecosystems, still their genetic diversity is understood inadequately. In this study, molecular identification of Nereididae polychaetes was performed by sequencing a segment of mitochondrial COI gene, isolated from mitochondrial DNA, and comparing nucleotide divergence, Molecular taxonomy, interspecific and intraspecific relations of Nereid species among ۴ intertidal stations assigned in Persian Gulf of Iran. Analysis of ۱۰۹ identified specimens, revealed ۷۸ provisional gene sequences, related to ۹ species and ۶ genera, in which interspecific divergence was ۱.۴ times higher than intraspecific divergence (۲.۸۲% versus ۱.۹۵%). The average pairwise sequence divergence for all sequences was estimated at ۱.۳۷%. In three cases maximum divergence within a lineage exceeded the minimum nearest-neighbor distance: Perinereis sp., Platynereis sp. and Platynereis bicanaliculata. Maximum species similarity was observed amongst ۳ sampling sites assigned in Bushehr Province whilst Bandar Abbas`s specimens showed less similarity to Bushehr station. Out of the ۱۰۹ COI gene sequences of Nereididae polychaetes in this study, ۳۴ contained multiple lineages. These results support the assertion that many Nereid populations in the Persian Gulf previously thought of as a single species, actually consist of two or more divergent lineages.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

S. Amiri

Marine Biology Group, Marine Science and Technology Department, Islamic Azad University Science and Research Branch, Tehran, Iran.

P. Ghavam Mostafavi

Marine Biology Group, Marine Science and Technology Department, Islamic Azad University Science and Research Branch, Tehran, Iran.

M.B. Nabavi

Marine Biology Group, Oceanic and Marine Science Department, Khorramshahr Marine Science and Technology University, Khorramshahr, Iran

M.H. Shahhosseini

Islamic Azad University Shar-e-Qods Branch, Qods, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahmad Al-Omari, N.H., ۲۰۱۱. Polychaetes (Annelida) in Qatar marine sediments. ...
  • Baghernezhad, N., Salari-Aliabadi, M.A., Ronagh, M.A. and Vazirizadeh, A., ۲۰۱۵. ...
  • Bakken, T. and Wilson, R.S., ۲۰۰۵. Phylogeny of nereidids (Polychaeta, ...
  • Barroso, R., Klautau, M., Solé-Cava, A.M. and Paiva, P.C., ۲۰۰۹. ...
  • Bastrop, R. and Blank, M., ۲۰۰۶. Multiple invasions – A ...
  • Bleidorn, C., Albrecht, S. and Bartolomaeus, T., ۲۰۰۶. Mitochondrial sequence ...
  • Bonyadi-Naeini, A., Rastegar-Pouyani, N., Rastegar-Pouyani, E., Glasby, C.J. and Rahimian, ...
  • Brasier, M.J., Wiklund, H., Neal, L., Jeffreys, R., Linse, K., ...
  • Bush, L., ۲۰۰۶. Identification and distribution of the polychaete family ...
  • Carr, C.M., Hardy, S.M., Brown, T.M., Macdonald, T.A. and Hebert, ...
  • Chao, A., Chazdon, R.L., Colwell, R.K. and Shen, T., ۲۰۰۵. ...
  • Chen, J., Farrell, J.W., Murray, D.W. and Prell, W.L., ۱۹۹۵. ...
  • Chevaldonne, P., Jollivet, D., Desbruyeres, D., Lutz, R.A. and Vrijenhoek, ...
  • Chia, F.S., Buckland-Nicks, J. and Young, C.M., ۱۹۸۴. Locomotion of ...
  • Colwell, R.K., ۲۰۰۹. Estimates: Statistical estimation of species richness and ...
  • Dahlgren, T.G., Lundberg, J., Pleijel, F. and Sundberg, P., ۲۰۰۰. ...
  • Darya, M., Sajjadi, M. and Sourinejad, I., ۲۰۱۶. Determination of ...
  • Day, J.H., ۱۹۶۷. A monograph on the Polychaeta of Southern ...
  • Dean, H.K., ۲۰۰۱. Some Nereididae (Annelida: Polychaeta) from the Pacific ...
  • Fauchald, K., ۱۹۷۷. The polychaete worms: Definitions and keys to ...
  • Felsenstein, J., ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: An approach using ...
  • Folmer, O., Black, M., Hoeh, W., Lutz, R. and Vrijenhoek, ...
  • Glover, A.G., Goetze, E., Dahlgren, T.G. and Smith, C.R., ۲۰۰۵. ...
  • Goloboff, P.A., ۱۹۹۹. Analyzing large data sets in reasonable times: ...
  • Hardy, S.M., Carr, C.M., Hardman, M., Steinke, D., Corstorphine, E. ...
  • Hartman, O., ۱۹۶۵. Catalogue of the polychaetous annelids of the ...
  • Hebert, P.D.N., Cywinska, A., Ball, S.L. and deWaard, J.R., ۲۰۰۳. ...
  • Jiang, M.X. and Liu, M.H., ۲۰۰۸. Research progress of Nereididae. ...
  • Jolly, M.T., Viard, F., Gentil, F., Thiébaut, E. and Jollivet, ...
  • Jones, D.A., ۱۹۸۶. A field guide to the seashores of ...
  • Knowlton, N., ۱۹۹۳. Sibling species in the sea. Annual Review ...
  • Knowlton, N., ۲۰۰۰. Molecular genetic analyses of species boundaries in ...
  • Manchenko, G.P. and Radashevsky, V.I., ۱۹۹۳. Genetic differences between two ...
  • Marko, P.B., ۲۰۰۴. ‘What’s larvae got to do with it?’ ...
  • Mehr, S., Verdes, A., Desalle, R., Sparks, J., Pieribone, V. ...
  • Metaxas, A., ۲۰۰۱. Behaviour in flow: perspectives on the distribution ...
  • Mooraki, N., ۲۰۱۴. Using polychaetes as an assessment tool for ...
  • Nikouyan, A. and Savari, A., ۱۹۹۹. Distribution and biomass of ...
  • Nei, M. and Kumar, S., ۲۰۰۰. Molecular evolution and phylogenetics. ...
  • Nygren, A. and Pleijel, F., ۲۰۱۰. From one to ten ...
  • Nygren, A., Norlinder, E., Panova, M. and Pleijel, F., ۲۰۱۱. ...
  • Olson, M.A., Zajac, R.M. and Russello, M.A., ۲۰۰۹. Estuarine-scale genetic ...
  • Pleijel, F., Rouse, G. and Nygren, A., ۲۰۰۹. Five colour ...
  • Qian, C.Y., Bu, Y. and Luan, Y.X., ۲۰۱۸. DNA barcoding ...
  • Quijo´n, P.A. and Snelgrove, P.V.R., ۲۰۰۵. Polychaete assemblages of a ...
  • Rice, S.A., Stephen, K. and Rice, K.A., ۲۰۰۸. The Polydora ...
  • Rockman, M.V., ۲۰۱۲. Patterns of nuclear genetic variation in the ...
  • Rouse, G,W. and Fauchald, K., ۱۹۹۷. Cladistics and polychaetes. Zoologica ...
  • Rouse, G.W. and Pleijel, F., ۲۰۰۱. Polychaetes. Oxford: Oxford University ...
  • Rozbaczylo, N., Moreno, R.A. and Díaz-Díaz, O., ۲۰۰۵. Poliquetos bentónicos ...
  • Salehi Farsani, A., Ahmadi, S., Negarestan, H. and Emadi, H., ...
  • Santos, C.S.G., Pleijel, F., Lana, P. and Rouse, G.W., ۲۰۰۵. ...
  • Sato, M. and Masuda, Y., ۱۹۹۷. Genetic differentiation in two ...
  • Scheltema, R.S., ۱۹۸۶. On dispersal and planktonic larvae of benthic ...
  • Sekar, V., Rajasekaran, R., Prasannakumar, C., Sankar, R., Sridhar, R. ...
  • Soleimanirad, A., Kamrani, E., Keshavarz, M., Bahremand, M. and Vazirizade, ...
  • Sørensen, T.A., ۱۹۴۸. A method of establishing groups of equal ...
  • Swofford, D.L., ۲۰۰۱. Phylogenetic analysis using parsimony, version ۴b۱۰. Sinauer ...
  • Teske, P.R., Golla, T.R., Sandoval-Castillo, J., Emami-Khoyi, A., Lingen, C.D.V.D., ...
  • Ushakov, P.V., ۱۹۶۵. Polychaeta of the far Eastern Seas of ...
  • Valentini, A., Pompanon, F. and Taberlet, P., ۲۰۰۹. DNA barcoding ...
  • Valvassori, G., ۲۰۱۷. Genomic and phenotypic analyses of polychaete sibling ...
  • Vogler, A. and Monaghan, M.T., ۲۰۰۶. Recent advances in DNA ...
  • Westheide, W. and Schmidt, H., ۲۰۰۳. Cosmopolitan versus cryptic meiofaunal ...
  • Witt, J.D.S., Threloff, D.L. and Hebert, P.D.N., ۲۰۰۶. DNA barcoding ...
  • Worheide, G., Sole´-Cava, A.M. and Hooper, J.N.A., ۲۰۰۵. Biodiversity, molecular ...
  • Young, C.M., ۱۹۹۵. Behavior and locomotion during the dispersal phase ...
  • نمایش کامل مراجع