شناسایی، ساختار و واکاوی فیلوژنتیکی خانواده ژن MLO (Mildew Resistance Locus O) در گونه های Triticum aestivum وMalus domestica

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 104

فایل این مقاله در 21 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-56-3_003

تاریخ نمایه سازی: 2 اسفند 1400

چکیده مقاله:

نقش ژن Mlo در گیاه جو با توجه به اینکه آلل جهش یافته ی mlo باعث ایجاد یک مقاومت غیراختصاصی و وسیع در برابر بیماری سفیدک پودری ناشی از قارچ Blumeria graminis f. sp. hordei می شود، کشف گردید. ژن های Mlo همچنین در رشد گیاهان و در پاسخ به تنش های زیستی و غیر زیستی نقش مهمی ایفا می کنند. خانواده ژن Mlo در چندین گونه گیاهی مورد بررسی قرار گرفته است. در این تحقیق برای آشکار کردن خصوصیات ژنتیکی و ساختار پروتئینی خانواده ژن Mlo در گیاهان گندم نان (Triticum aestivum) و سیب (Malus domestica) از ابزارهای بیوانفورماتیکی و موتورهای جستجو در پایگاه های اطلاعات ژنومی استفاده گردید. توالی های پروتئینی Mlo مربوط به گیاه آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana) به عنوان الگو جهت tBLASTn استفاده شد که در نهایت منجر به شناسایی ۲۹ عضو پروتئینی MdMlo و ۱۱ عضو پروتئینی TaMlo گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک مقایسه ای، پروتئین های MdMlo و TaMlo را به سه خوشه اصلی تقسیم بندی کرد و نشان داد که صرف نظر از نوع گونه ی گیاهی، Mlo۱ها (عضو اول خانواده پروتئین Mloدر گیاهان سیب، گندم و آرابیدوپسیس)، Mlo۲ها، Mlo۳ها و به همین ترتیب تا Mlo۱۲ها، با همدیگر ارتباط نزدیکی دارند. این نتیجه بیانگر این امر است که پس از جدایی این گونه ها، هیچ گسترش دیگری در خانواده ژن Mlo وجود نداشته است. موتیف های کارکردی محافظت شده موجود در پروتئین های Mlo با استفاده از ابزار MEME بررسی شد و مشخص شد که حداکثر ۱۵ و حداقل ۱۰ موتیف حفاظت شده در ساختار پروتئینی آن ها وجود دارد.

نویسندگان

علی حسینی بدربانی

دانشگاه کردستان. دانشکده کشاورزی

جهانشیر امینی

گروه آموزشی گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • ACEVEDO‐GARCIA, J., KUSCH, S. and PANSTRUGA, R.۲۰۱۴. Magical mystery tour: ...
  • ALTSCHUL, S. F., GISH, W., MILLER, W., MYERS, E. W. ...
  • ATZEMA, J. L.۱۹۹۸. Durability of mlo resistance in barley against ...
  • BAILEY, T. L., WILLIAMS, N., MISLEH, C. and LI, W. ...
  • BURGE, C. and KARLIN, S.۱۹۹۷. Prediction of complete gene structures ...
  • BÜSCHGES, R., HOLLRICHER, K., PANSTRUGA, R., SIMONS, G., WOLTER, M., ...
  • CHEN, Z., HARTMANN, H. A., WU, M.-J., FRIEDMAN, E. J., ...
  • CHEN, Z., NOIR, S., KWAAITAAL, M., HARTMANN, H. A., WU, ...
  • CONSONNI, C., HUMPHRY, M. E., HARTMANN, H. A., LIVAJA, M., ...
  • DESHMUKH, R., SINGH, V. and SINGH, B.۲۰۱۶. Comparative analysis of ...
  • DEVOTO, A., PIFFANELLI, P., NILSSON, I., WALLIN, E., PANSTRUGA, R., ...
  • ELLIOTT, C., MÜLLER, J., MIKLIS, M., BHAT, R. A., SCHULZE-LEFERT, ...
  • ELLIOTT, C., MÜLLER, J., MIKLIS, M., SCHULZE-LEFERT, P. and PANSTRUGA, ...
  • FEECHAN, A., JERMAKOW, A. M. and DRY, I. B.۲۰۰۹. Grapevine ...
  • FILIZ, E. and VATANSEVER, R.۲۰۱۸. Genome-wide identification of mildew resistance ...
  • FRANCESCHINI, A., SZKLARCZYK, D., FRANKILD, S., KUHN, M., SIMONOVIC, M., ...
  • FU, X. L., LU, Y. G., LIU, X. D. and ...
  • GASTEIGER, E., HOOGLAND, C., GATTIKER, A., WILKINS, M. R., APPEL, ...
  • GUO, A., ZHU, Q., CHEN, X. and LUO, J.۲۰۰۷. GSDS: ...
  • HALL, T. A.۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • HUMPHRY, M., REINSTAEDLER, A., IVANOV, S., BISSELING, T. and PANSTRUGA, ...
  • JAROSCH, B., JANSEN, M. and SCHAFFRATH, U.۲۰۰۳. Acquired resistance functions ...
  • JØRGENSEN, I. H.۱۹۹۲. Discovery, characterization and exploitation of Mlo powdery ...
  • JUNG, E. H., JUNG, H. W., LEE, S. C., HAN, ...
  • KĘDZIERSKI, Ł., MONTGOMERY, J., CURTIS, J. and HANDMAN, E.۲۰۰۴. Leucine-rich ...
  • KEMMERLING, B., SCHWEDT, A., RODRIGUEZ, P., MAZZOTTA, S., FRANK, M., ...
  • KIM, D. S. and HWANG, B. K.۲۰۱۲. The pepper MLO ...
  • KIM, M. C., LEE, S. H., KIM, J. K., CHUN, ...
  • KIM, M. C., PANSTRUGA, R., ELLIOTT, C., MÜLLER, J., DEVOTO, ...
  • KONISHI, S., SASAKUMA, T. and SASANUMA, T.۲۰۱۰. Identification of novel ...
  • KUMAR, J., HÜCKELHOVEN, R., BECKHOVE, U., NAGARAJAN, S. and KOGEL, ...
  • KYTE, J. and DOOLITTLE, R. F.۱۹۸۲. A simple method for ...
  • LESCOT, M., DÉHAIS, P., THIJS, G., MARCHAL, K., MOREAU, Y., ...
  • LIM, C. W. and LEE, S. C.۲۰۱۴. Functional roles of ...
  • LIU, J.-H., PENG, T. and DAI, W.۲۰۱۴. Critical cis-acting elements ...
  • LIU, Q. and ZHU, H.۲۰۰۸. Molecular evolution of the MLO ...
  • NEKRASOV, V., WANG, C., WIN, J., LANZ, C., WEIGEL, D. ...
  • OSAKABE, Y., MARUYAMA, K., SEKI, M., SATOU, M., SHINOZAKI, K. ...
  • PANDA, S. and CHANDRA, G.۲۰۱۲. Physicochemical characterization and functional analysis ...
  • PANSTRUGA, R.۲۰۰۵a. Discovery of novel conserved peptide domains by ortholog ...
  • PANSTRUGA, R.۲۰۰۵b. Serpentine plant MLO proteins as entry portals for ...
  • PARLEVLIET, J.۱۹۹۳. What is durable resistance, a general outline. Pp. ...
  • PAVAN, S., JACOBSEN, E., VISSER, R. G. and BAI, Y.۲۰۱۰. ...
  • PESSINA, S., PAVAN, S., CATALANO, D., GALLOTTA, A., VISSER, R. ...
  • PIFFANELLI, P., ZHOU, F., CASAIS, C., ORME, J., JAROSCH, B., ...
  • PUNTA, M., COGGILL, P., EBERHARDT, R., MISTRY, J., TATE, J., ...
  • QUEVILLON, E., SILVENTOINEN, V., PILLAI, S., HARTE, N., MULDER, N., ...
  • REDDY, V. S., ALI, G. S. and REDDY, A.۲۰۰۳. Characterization ...
  • SEVEROGLU, Z. and OZYIGIT, I. I.۲۰۱۲. Powdery mildew disease in ...
  • SHEN, Q., ZHAO, J., DU, C., XIANG, Y., CAO, J. ...
  • SINGH, V., SINGH, A., CHAND, R. and SINGH, B.۲۰۱۲. Genome ...
  • SWARBRECK, D., WILKS, C., LAMESCH, P., BERARDINI, T. Z., GARCIA-HERNANDEZ, ...
  • THOMPSON, J. D., HIGGINS, D. G. and GIBSON, T. J.۱۹۹۴. ...
  • TORII, K. U.۲۰۰۴. Leucine-rich repeat receptor kinases in plants: structure, ...
  • TUSNADY, G. E. and SIMON, I.۲۰۰۱. The HMMTOP transmembrane topology ...
  • VELASCO, R., ZHARKIKH, A., AFFOURTIT, J., DHINGRA, A., CESTARO, A., ...
  • YU, C. S., CHEN, Y. C., LU, C. H. and ...
  • ZAIDI, S. S.-E.-A., MUKHTAR, M. S. and MANSOOR, S.۲۰۱۸. Genome ...
  • نمایش کامل مراجع