تغییر بیان ژن های مرتبط با اتوفاژی در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب زمینی (Potato virus A) در گیاه Nicotiana benthamiana

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 195

فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-53-1_005

تاریخ نمایه سازی: 18 اسفند 1400

چکیده مقاله:

در سال­های اخیر نقش اتوفاژی در خاموشی آر­ان­ای القاء شده توسط ویروس از طریق فعالیت پروتئین­های سرکوبگر خاموشی آر­ان­ای به اثبات رسیده است. به منظور درک بهتر نقش احتمالی سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب ­­زمینی در فرآیند اتوفاژی (autophagy)، اثر این سرکوبگر ویروسی روی بیان تعدادی از ژن­های مهم و دخیل در اتوفاژی مورد بررسی قرار گرفت. ژنHC-Pro  ویروس ای سیب ­­زمینی در ناقل بیان pGWB۱۷ با برچسبmyc  در انتهای کربوکسیلی و پروموتور ۳۵S در انتهای آمینی توسط تکنولوژی  gatewayهمسانه­سازی شد. کشت­های اگروباکتریوم حاوی  HC-Proویروس ای سیب ­زمینی با استفاده از سرنگ در ناحیه پشتی برگ­های گیاه Nicotiana benthamianaتزریق شدند. بیان ژن­های ATG۲، ATG۷،  ATG۶و AGO۱در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب ­زمینی، در فاصله زمانی پنج روز پس از تزریق، با استفاده از تکنیک ریل تایم پی­سی­آر (Real-Time PCR) اندازه­گیری شدند. سرکوبگر خاموشیHC-Pro   ویروس ای سیب ­زمینی میزان بیان ژن­های ATG۶، ATG۲و ATG۷را به میزان ۸۹/۵، ۳/۷ و ۶/۷ برابر نسبت به برگ­های تزریق شده با سازه حاوی پلاسمید خالی pGWB افزایش داد. در حالی­که میزان رونوشت  AGO۱به­عنوان جزء کلیدی کمپلکس خاموشی القاء شده توسط آر­ان­ای، به میزان ۳۶/۱ برابر نسبت به میزان آن در برگ­های فاقد  HC-Proکاهش نشان داد. نتایج این تحقیق حاکی از دخالت ژن­های ATG۲، ATG۷، ATG۶و AGO۱در پاسخ­های دفاعی گیاه  N .benthamianaدر مقابل سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب­ زمینی و امکان استفاده از آن در تدوین روش­های جدید مدیریت ویروس­های گیاهی می­باشد.

کلیدواژه ها:

اتوفاژی ، سرکوبگر خاموشی ، HC-Pro ، Nicotiana benthamiana ، خاموش سازی آر ان ای

نویسندگان

امین الله طهماسبی

دانشجویان دکتری، مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.

علیرضا افشاریفر

دانشیار مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

سمیرا ربیعی

دانشجویان دکتری، مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.

کرامت ایزدپناه

استاد مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Agius C., Eamens A. L., Millar A. A., Watson J. ...
  • Alvarado V. Y. and Scholthof H. B. ۲۰۱۲. AGO۲: a ...
  • Ascencio-Ibáñez J. T., Sozzani R., Lee T.J., Chu T. M., ...
  • Azevedo J., Garcia D., Pontier D., Ohnesorge S., Yu A., ...
  • Ballut L., Drucker M., Pugniere M., Cambon F., Blanc S., ...
  • Bassham D. C., Laporte M., Marty F., Moriyasu Y., Ohsumi ...
  • Boya P., Reggiori F. and Codogno P. ۲۰۱۳. Emerging regulation ...
  • Brigneti G., Voinnet O., Li W. X., Ji L. H., ...
  • Carbonell A. and Carrington J. C. ۲۰۱۵. Antiviral roles of ...
  • Cheng X. and Wang A. ۲۰۱۷. The potyvirus silencing suppressor ...
  • Chiera J. M., Bouchard R. A., Dorsey S. L., Park ...
  • Chiera J. M., Lindbo J. A. and Finer J. J. ...
  • Chiu M. H., Chen I. Baulcombe D. C. and Tsai ...
  • Chung T., Suttangkakul A. and Vierstra R. D. ۲۰۰۹. The ...
  • Deretic V. ۲۰۱۲. Autophagy as an innate immunity paradigm: expanding ...
  • Derrien B., Baumberger N., Schepetilnikov M., Viotti C., De Cillia ...
  • Ding S. W. ۲۰۱۰. RNA-based antiviral immunity. Nature Reviews Immunology ...
  • Duncan D. B. ۱۹۵۱. A significance test for differences between ...
  • Garcia-Ruiz H., Carbonell A., Hoyer J. S., Fahlgren N., Gilbert ...
  • Germundsson A., Savenkov E. I., Ala-Poikela M. and Valkonen J. ...
  • Giner A., Lakatos L., García-Chapa M., López-Moya J. J. and ...
  • Gursinsky T., Pirovano W., Gambino G., Friedrich S., Behrens S. ...
  • Han T., Chen Q. and Liu H. ۲۰۱۶. Engineered photoactivatable ...
  • Harvey J. J., Lewsey M. G. Patel K. Westwood J. ...
  • Harvey J. J., Lewsey M. G., Patel K., Westwood J., ...
  • Havelda Z., Várallyay É., Válóczi A. and Burgyán J. ۲۰۰۸. ...
  • Inoue Y., Suzuki T., Hattori M., Yoshimoto K., Ohsumi Y. ...
  • Jauber M., Bhattacharjee S., Mello A. F., Perry K. L. ...
  • Johansen L. K. and Carrington J. C. ۲۰۰۱. Silencing on ...
  • Kasschau K. D. and Carrington J. C. ۱۹۹۸. A counter ...
  • Klionsky D. J. ۲۰۰۵. The molecular machinery of autophagy: unanswered ...
  • Levine B., Mizushima N. and Virgin H. W. ۲۰۱۱. Autophagy ...
  • Li F. and Ding S. W. ۲۰۰۶. Virus counter defense: ...
  • Liu Y. and Bassham D. C. ۲۰۱۲. Autophagy: pathways for ...
  • Liu L., Chung H. Y., Lacatus G., Baliji S., Ruan ...
  • Liu Y., Schiff M., Czymmek K., Tallóczy Z., Levine B. ...
  • Livak K. J. and Schmittgen T. D. ۲۰۰۱. Analysis of ...
  • Lukhovitskaya N. I., Solovieva A. D., Boddeti S. K., Thaduri ...
  • Lukhovitskaya N. I., Vetukuri R. R., Sama I., Thaduri S., ...
  • Miozzi L., Napoli C., Sardo L. and Accotto G. P. ...
  • Morel J. B., Godon C., Mourrain P., Béclin C., Boutet ...
  • Nakagawa T., Kurose T., Hino T., Tanaka K., Kawamukai M., ...
  • Nakahara K. S., Masuta C., Yamada S., Shimura H., Kashihara ...
  • Pirone T. P. and Blanc S. ۱۹۹۶. Helper-dependent vector transmission ...
  • Qu F., Ye X. and Morris T. J. ۲۰۰۸. Arabidopsis ...
  • Rajamaki M. L., Maki-Valkama T., Makinen K. and Valkonen J. ...
  • Redondo E., Krause-Sakate R., Yang S. J., Lot H., Le ...
  • Rojas M. R., Zerbini F. M., Allison R. F., Gilbertson ...
  • Sahana N., Kaur H., Tena F., Jain R. K., Palukaitis ...
  • Scholthof K. B. G., Adkins S., Czosnek H., Palukaitis P., ...
  • Shin J. H., Yoshimoto K., Ohsumi Y., Jeon J. S. ...
  • Shoji-Kawata S. and Levine B. ۲۰۰۹. Autophagy, antiviral immunity, and ...
  • Sláviková S., Shy G., Yao Y., Glozman R., Levanony H., ...
  • Stephan D., Slabber C., George G., Ninov V., Francis K. ...
  • Su W., Ma H., Liu C., Wu J. and Yang ...
  • Tadamura K., Nakahara K. S., Masut C. and Uyeda I. ...
  • Urcuqui-Inchima S., Haenni A. L. and Bernardi F. ۲۰۰۱. Potyvirus ...
  • Várallyay É., Válóczi A., Ágyi Á., Burgyán J. and Havelda ...
  • Vaucheret H. ۲۰۰۸. Plant argonautes. Trends in Plant Science ۱۳(۷): ...
  • Voinnet O. ۲۰۰۵. Induction and suppression of RNA silencing: insights ...
  • Voinnet O. ۲۰۰۹. Origin, biogenesis, and activity of plant microRNAs. ...
  • Voinnet O., Rivas S., Mestre P. and Baulcombe D. ۲۰۰۳. ...
  • Wang X. B., Jovel J., Udomporn P., Wang Y., Wu ...
  • Wang Y., Gaba V., Yang J., Palukaitis P. and Gal-On ...
  • Wang Y., Yu B., Zhao J., Guo J., Li Y., ...
  • Weigel D. and Glazebrook J. ۲۰۰۶. Transformation of agrobacterium using ...
  • Xiong Y., Contento A. L., Nguyen P. Q. and Bassham ...
  • Zhang X., Yuan Y. R., Pei Y., Lin S. S., ...
  • Zhang Y. H. P., Himmel M. E. and Mielenz J. ...
  • Zhou T., Murphy A. M., Lewsey M. G., Westwood J. ...
  • نمایش کامل مراجع