بررسی وضعیت تاکسونومیکی جدایه های اکسیداز مثبت سودوموناس دخیل در پوسیدگی غلاف برنج در استان مازندران با استفاده از – RFLP ۱۶S rRNA *

به منظور شناسایی و بررسی روابط جدایه های اکسیداز، آرژنین دی هیدرولاز مثبت جنس سودوموناس دخیل در پوسیدگی غلاف برنج، ۳۵ جدایه جمع آوری شده همراه با سه جدایه استاندارد با استفاده از آزمون های بیماری زایی، بیوشیمیایی و الگوی نقوش پروتیینی مورد ارزیابی قرار گرفتند. براساس تجزیه و تحلیل خوشه ای داده های بیوشیمیایی، جدایه ها در چهار کلاستر متمایز و دو گروه تک عضوی گروه بندی شدند. با مقایسه نقوش پروتیینی و هم چنین خصوصیات بیماری زایی، نوع رقم و محل جغرافیایی جدایه های مورد مطالعه، یک یا چند جدایه نماینده از هریک از این کلاستر ها انتخاب شدند. جدایه های نماینده به همراه سه گونه استاندارد Pseudomonas fuscovaginae،P. marginalis وP. fluorescense با استفاده از PCR – RFLP ژن ۱۶S rRNA مورد مطالعه قرار گرفتند. با تجزیه و تحلیل خوشه ای داده های حاصل از الگو های برشی آنزیم های محدود شکن این جدایه ها در شش خوشه و ژنوتیپ متمایز از هم گروه بندی شدند. جدایه های بیماری زای مورد مطالعه در چهار ژنوتیپ شامل P. marginalis و سه ژنوتیپ متمایز از هم و متفاوت از جدایه های استاندارد مورد مقایسه قرار گرفتند. هیچ یک از جدایه های مورد مطالعه دارای ژنوتیپ مشابه جدایه استاندارد P. fuscovaginaeکه یکی از مهم ترین عوامل پوسیدگی و تغییر رنگ دانه می باشد، نبودند.