ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته دار در چند استان شمالی ایران *

باکتری (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری های بسیاری روی محصولات زراعی و باغی می باشد یکی از مهم ترین بیماری های ناشی از این باکتری شانکر، لکه برگی و نکروز پوست در درختان میوه هسته دار (هلو، شلیل، زردآلو، آلو و گیلاس) است. به منظور بررسی همسانی یا تنوع جدایه های عامل بیماری، طی سال های ۱۳۸۶-۱۳۸۸ از باغات درختان میوه هسته دار واقع در مناطق مختلف استان های اردبیل، گیلان، مازندران و خراسان رضوی نمونه برداری صورت گرفت. باکتری های جداشده از بافت های آلوده جوانه، برگ، شاخه و تنه بر اساس آزمون های گروه LOPAT و GATTa، Pss شناسایی شدند. تعداد ۷۰ جدایه مورد بررسی های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی) و الکتروفورز پروتئین های سلولی ( SDS-PAGE) قرار گرفتند. جدایه ها از نظر خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین های سلولی اختلاف های جزئی نشان دادند. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی، DNA ژنومی جدایه ها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (rep-PCR) با استفاده از آغازگرهای ERIC و REP بررسی شد. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده نشان داد که در ERIC-PCR در سطح تشابه ۷۵ درصد، جدایه ها به ۸ گروه و با  REP-PCR به ۵ گروه و با ترکیب همه آغازگرها به ۹ گروه تقسیم شدند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه های Pss عامل بیماری شانکر درختان میوه هسته دار بود.