توسعه دقت و حساسیت روش های نوین در ردیابی باکتری Erwinia amylovora در مواد گیاهی با آلودگی های پنهان

بیماری آتشک با عامل Erwinia amylovora یکی از مهم ترین و مخرب ترین بیماری های خانواده گل سرخیان است. روش هایی که با سرعت و حساسیت زیاد پاتوژن را ردیابی می کنند ابزار مهمی در کنترل بیماری هستند. در این تحقیق حساسیت و دقت چهار روش تشخیصی مختلف بدون غنی سازی و به همراه غنی سازی مقایسه و ارزیابی گردید. روش کشت روی محیط نیمه انتخابی CCT تا CFU/ml۱ باکتری E. amylovoraرا از عصاره گیاه آلوده تشخیص داد اما قادر به ردیابی آلودگی پنهان نبود. با استفاده از غنی سازی تشخیص و ردیابی باکتری در آلودگی های پنهان امکانپذیر شد. روشLateral flow immuno Chromatography غلظت CFU/ml ۱۰۵ باکتریدر عصاره گیاه آلوده را شناسایینمود، ولی پس از غنی سازی علاوه بر توان ردیابی باکتری در شرایط آلودگی پنهان، دقت تشخیص این آزمون صد هزار برابر یعنی تا CFU/ml ۱ افزایش پیدا کرد. روش PCR معمول و PCR آشیانه ای با استفاده از آغازگرهای اختصاصی با موفقیت قادر به ردیابی آلودگی پنهان و جمعیت های پایین باکتری در حد  CFU/ml۱ باکتری در عصاره گیاهی با غنی سازی و بدون غنی سازی شد. غنی سازی تاثیری در افزایش دقت این آزمون مولکولی نداشت هرچند که در ردیابی سلول های زنده باکتری بسیار موثر است.