بررسی روابط تکاملی و فیلوژنتیکی microRNA های موثر در تنش های خشکی و شوری در گونه های Brassica

کلزا گیاهی آلوتتراپلوئید از خانواده Brassicaceae است که از تلاقی دو گونه دیپلوئید Brassica oleracea و Brassica rapa به وجود آمده است. بنابراین با بررسی ژنوم این گیاه می توان به نقاط مشترک زیادی با گونه های فوق دست یافت. از جملهاین توالی های همسان در بین گونه ها می توان miRNA ها را نام برد. MicroRNA ها یکی از تنظیم کننده های بیان ژن پس ازرونویسی هستند که نقش اساسی در پاسخ به تنش های غیر زیستی ایفا می کنند. در این پژوهش به صورت بیوانفورماتیکی بهبررسی این ویژگی حفاظت شدگی miRNA ها پرداخته شد. ابتدا به کمک بررسی منابع miRNA های موثر در تنش خشکی وشوری در کلزا استخراج شد و سپس با کمک ابزارهای بیوانفورماتیکی miRNA ها مشترک در بین سه گونه B. napus ، B. rapa و B. oleracea مشخص شد و حفاظت شدگی این توالی ها مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج نشان دهنده حفاظت شدگیبالای این miRNA ها بخصوص در توالی بالغ بود و حتی miR۸۶۰ در توالی اولیه مشابهت کامل بین دو گونه B. napus و B. rapa نشان داد که حاکی از منشا مشترک و حفاظت شدکی بالای آن می باشد.