تنوع ژنتیکی جدایه های Acidovorax oryzae عامل نوار قهوه ای برنج در استان مازندران

بیماری نوار قهوه ای برنج (brown stripe of rice ) یکی از بیماری های شایع در خزانه های برنج (Oryza  sativa)  می باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی عامل نوار قهوه ای برنج، نمونه برداری، در فصول زراعی ۱۳۹۱-۱۳۹۰ از خزانه های مازندران انجام شد. عامل بیماری بر اساس آزمون های بیوشیمیائی، فیزیولوژیکی و بیماری زائی Acidovorax  avenae subsp. avenae ( Acidovorax oryzae)  تشخیص داده شد. تعداد ۹۰ جدایه مورد بررسی های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و بیوشیمیائی) و الکتروفورز پروتئین های سلولی (SDS-PAGE) قرار گرفتند. از نظر خصوصیات فنوتیپی تنوعی در میان جدایه ها مشاهده نشد. نتایج به دست آمده از آنالیز خوشه ای پروتئینی سلولها، جدایه ها را در سطح تشابه ۴۵ درصد به ۲ گروه و در سطح تشابه ۶۸ درصد به ۵ گروه تفکیک کرد. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی،DNA  ژنومی جدایه ها استخراج و در واکنش زنجیره ای پلیمراز (rep-PCR) با استفاده از آغازگرهای ERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت.  دندروگرام با روش مقایسه جفت ها از طریق میانگین های بی وزن (UPGMA) و با استفاده از نرم افزار NTSYS ترسیم گردید. آنالیز خوشه ای نتایج به دست آمده با آغازگر ERIC نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه۲۰ ، ۳۵ و ۶۵ درصد به ترتیب در ۲ ، ۵ و ۱۰ گروه و با آغازگر  BOX در سطح تشابه   ۲۰ ، ۵۰ و ۸۰  به ترتیب به ۷ ، ۱۶ و ۲۳ گروه دسته بندی شدند. نتایج بیانگر وجود تنوع ژنتیکی بالائی در جمعیت Ao  عامل نوار قهوه ای برنج بود