ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های عامل بیماری نوار قهوه ای برنج با استفاده از rep-PCR *

بیماری نوار قهوه ای برنج (brown stripe of rice) از خزانه های برنج (Oryza  sativa L.)استان مازندران گزارش و عامل آن(Aaa)Acidovorax avenae subsp. avenae  شناسایی شده است (Rahimian. ۱۹۸۶, Iran Agric. Res. ۵: ۶۳-۷۱). بررسی حاضر به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های به دست آمده از خزانه های برنج استان مازندران انجام گرفت. پس از کشت نمونه های دارای علائم نوار قهوه ای و بر اساس آزمون های بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی، جدایه ها به عنوان Aaa  شناسایی و برای بررسی ژنوتیپی به کار برده شدند. نتایج آزمون های اکسیداز، کاتالاز، هیدرولیز نشاسته، هیدرولیز کازئین و هیدرولیز توئین ۸۰ مثبت بودند. جدایه ها از سوربیتول و مانیتول به عنوان منبع کربنی استفاده کرده ولی قادر به استفاده از سوکروز و سالیسین نبودند(Rahimian. ۱۹۸۶, Iran Agric. Res. ۵: ۶۳-۷۱). DNA ژنومی جدایه ها استخراج و انگشت نگاری DNA با rep-PCR و با استفاده ازآغازگرهای BOX و REP طبق روش های توصیه شده و با اندکی تغییر انجام گردید ( Versalovic  et al. ۱۹۹۱, Nucleic Acids Res. ۱۹: ۶۸۲۳-۶۸۳۱ ). گروه بندی جدایه ها با مقایسه نقوش قطعات DNA در ژل و نمره دهی بر پایه وجود یا عدم وجود قطعات همسان و با استفاده از ضریب تشابه جاکارد صورت گرفت. دندروگرام با روش مقایسه جفت ها از طریق میانگین های بی وزن (UPGMA) و با استفاده از نرم افزار NTSYS ۲.۰۲ ترسیم گردید. مقایسه نقوش قطعات DNA تکثیر شده درrep-PCR، نشان داد که در سطح تشابه ۲۰، ۵۰ و ۸۰ درصد جدایه ها با آغازگر BOX به ترتیب به ۷، ۱۶ و ۲۳ گروه و با آغازگر REP به ترتیب به ۵، ۱۳ و ۱۹ گروه دسته بندی شدند. خوشه بندی به دست آمده با نقوش حاصل از REP-PCR مطابقت بالایی با خوشه بندی انجام گرفته با BOX-PCRداشت. پیش از این گزارشی در زمینه وجود سطح بالایی از تنوع ژنتیکی در جمعیت های این عامل باکتریایی در دست نبوده است.