مطالعه پویش کامل ژنوم با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی برای شناسایی ژن ها و مسیرهای مرتبط با خلق و خوی در گاو براهمن
محل انتشار: فصلنامه تولیدات دامی، دوره: 23، شماره: 4
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 148
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAP-23-4_001
تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1401
چکیده مقاله:
درک کنترل ژنتیکی خلق و خوی به عنوان یک صفت پیچیده و دارای همبستگی با صفات اقتصادی یکی از اهداف اصلاح نژادی در صنعت گاو گوشتی است. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه های ژنی موثر بر صفات مرتبط با خلق و خوی گاو نژاد براهمن بود. بدین منظور از اطلاعات ژنوتیپی ۱۳۷۰ راس گاو براهمن و رکوردهای فنوتیپی شامل سرعت خروج، امتیاز پن و امتیاز خلق و خوی استفاده شد. ارزیابی پویش کامل ژنوم با PLINK نسخه ۱/۹۰ انجام شد. تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی بوسیله بسته نرم افزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در نهایت تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی از پایگاه های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده شد. با تجزیه و تحلیل غنی سازی مجموعه های ژنی، مسیرهای بیوشیمیایی و (ژن های کاندیدای) neurotransmitter secretion (NRXN۳ و CACNG۳)، Cycle Dopamine Neurotransmitter Release (PPFIA۲)، regulation of neuron projection development (GRID۲)، neuron projection (SLC۸A۱ و KCNQ۲)، Axonal growth inhibition (RTN۴R)، Neurotrophin signaling pathway (MAP۲K۲، MAP۳K۵ و PSEN۱) و Focal adhesion (TLN۲) مرتبط با سرعت خروج شناسایی شدند. ژن های کاندیدا شناسایی شده نقش مهمی در تفرق و تمایز سیناپس ها، انتقال دهنده های عصبی، بیماری های عصبی و اختلال روانی، استرس های اکسیداتیو و محیطی، گیرنده های هورمونی و هموستازی گلوکز داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته های این پژوهش می تواند در انتخاب ژنتیکی حیوانات با تولید بالاتر از طریق دام های آرام مفید باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسین محمدی
استادیار،گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک
امیر حسین خلت آبادی فراهانی
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست،دانشگاه اراک،
محمد حسین مرادی
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک
ابوذر نجفی
استادیار، گروه علوم دام و طیور، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، پاکدشت، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :