بهبود انرژی پیوندی نانوبادی (Nb) برعلیه فاکتور رشد جفتی (PLGF) توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD)
محل انتشار: ششمین کنفرانس تخصصی ترمودینامیک
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 228
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
THERMODYNAMICS06_002
تاریخ نمایه سازی: 28 خرداد 1401
چکیده مقاله:
مهندسی آنتی بادی اکنون یک حوزه قابل توجه در بیوداروها است زیرا نسل بعدی آنتی بادی های عرضه شده بهبازار آنتی بادی های مهندسی شده هستند. در مطالعه حاضر، افزایش میل ترکیبی نانوبادی (Nb) برعلیه فاکتور رشدجفتی (PLGF) توسط شبیهسازی دینامیک مولکولی (MD) انجام شد. با استفاده از نرم افزار های بیوانفوماتیکی وdocking جهش هاش مختلف مورد بررسی قرار گرفت و در نهایت، ۴ فرم جهش تک گانه در نانوبادی اولیه(V۰) شامل جهش ۱ . Leu۱۱۲ به (V۱)His ، جهش ۲ . Ser۳۱ به (V۲) Asp ، جهش ۳ . Ala۹۷ به V۳)Lys)،جهش ۴ . Arg۴۵ به V۴)Glu) و ۱ فرم جهش دوگانه جهش ۵ . Ser۳۱ به Asp و Arg۴۵ به V۵)Glu) به منظوربررسی جزییات بیشتر و بررسی میل ترکیبی از طریق محاسبه انرژی پیوند، توسط شبیه سازی های MD مورد تجزیهو تحلیل قرار گرفتند. بیشترین افزایش میل ترکیبی برای جهش Ser۳۱ به Asp در ورینت ۲ (V۲) به دلیل افزایشقابل توجهی در برهمکنش های قطبی و الکترواستاتیکی مشاهده شد. آنالیز ناحیه تماس و پیوند هیدروژنی وهمچنین اندازه گیری فاصله در نانوبادی های جهش یافته و PlGF نیز افزایش میل ترکیبی واریانت های جهش یافتهرا نسبت به شکل بومی تایید کرد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
قادر حسین زاده
گروه مهندسی شیمی، دانشکده فنی،دانشگاه بناب، بناب، ایران