تعیین ویژگی های مولکولی سه جدایه ویروس زردی بافت مرده ی باقلا به دست آمده از نخود در ایران
محل انتشار: مجله آفات و بیماریهای گیاهی، دوره: 86، شماره: 1
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 130
فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAEN-86-1_007
تاریخ نمایه سازی: 22 شهریور 1401
چکیده مقاله:
زردی از علائم شایع در مزارع نخود در دنیا و ایران می باشد. ویروس زردی بافت مرده باقلا (Faba bean necrotic yellows virus, FBNYV) از جنس Nanovirus، تیره Nanoviridae، از عوامل ویروسی همراه با عارضه زردی می باشد. در سال های ۱۳۹۵-۱۳۹۴ نمونه های نخود با علائم زردی از استان های لرستان و کرمانشاه جمع آوری و پس از استخراج دی ان ا، آلودگی به نانو ویروس با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی در آنها ردیابی گردید. دی ان ا نمونه های آلوده از طریق روش دایره غلطان (RCA) تغلیظ و با انجام هضم آنزیمی محصول (RCA) توسط آنزیم برشی Aat II، قطعات مختلف ژنومی ویروس با اندازه حدود یک کیلو جفت باز جداسازی گردید. قطعه ژنومی با اسامیDNA-R, DNA-S, DNA-C, DNA-N, DNA-M, DNA-U۱ DNA-U۲ و DNA-U۴ با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصیFBNYV، تکثیر و تعیین ترادف گردید. مقایسه ترادف قطعات ۸ گانه در سه جدایه ایرانی FBNYV با ترادف های موجود در بانک ژن GenBank نشانگر شباهت زیاد جدایه های ایرانی با دو جدایه FBNYV-[AZ; ۱۲] و FBNYV-[AZ; ۱۳.۵] از آذربایجان بود. درخت تبارزایی های رسم شده برای قطعات DNA-S, C, U۱ نشانگر شباهت زیاد آنها با قطعات مشابه در جدایه آذربایجان FBNYV-[AZ;۱۲] و در گروه مستقل (II) از سایر جدایه های دنیا قرار گرفتند. ترادف قطعات DNA-R,M,N,U۲,U۴ جدایه های ایرانی با جدایه دیگری از آذربایجان FBNYV-[AZ;۱۳.۵] بسیار شباهت داشته و در گروه مستقل (I) قرار گرفتند. تفاوت ژنتیکی بین دو جدایه آذربایجان در بین جدایه های ایرانی نیز مشاهده شد. نتایج بدست آمده فرضیه وقوع نوجوری بین جدایه های ایران و آذربایجان را حمایت می کند.
نویسندگان
یلدا سخن سنج
PhD. Student ; Department of Plant Pathology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
کاوه بنانج
Professor, Department of Plant Virus Research, Iranian Research Institute of Plant Protection, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran
فرشاد رخشنده رو
Assistant Professor,Department of Plant Pathology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
علی آهون منش
Professor, Foulad Institute Technology (FIT), Foulad-shahr, Isfahan-Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :