آنالیز فیلوژنتیکی چهار جدایه های ایرانی ویروس کوتولگی زرد کدوییان بر اساس انتهای ۳ آر. ان. ای شماره ۱ (مقاله ی کوتاه انگلیسی)
محل انتشار: مجله آفات و بیماریهای گیاهی، دوره: 85، شماره: 2
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 100
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAEN-85-2_014
تاریخ نمایه سازی: 23 شهریور 1401
چکیده مقاله:
به منظور آنالیز فیلوژنتیکی جدایه های ایرانی ویروس کوتولگی زرد کدوییان (Cucurbit yellow stunting disorder virus, CYSDV) ناحیه انتهای ¢۳ RNA۱ (به طول ۵۶۰ نوکلئوتید) از چهار جدایه ویروس کوتولگی زرد کدوییان جمع آوری شده از استان های بوشهر، کرمان (جیرفت)، خوزستان(دزفول) و تهران با واکنش زنجیره ای پلی مراز و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر شد. ترادف نوکلئوتیدی ناحیه مذکورتعیین و با توالی های موجود در Gen Bank مقایسه شد. نتایج نشان دهنده تشابه ترادف نوکلئوتیدی بالا (۹۸-۹۹%) بین جدایه های CYSDV بود و تشابه ترادف بین جدایه های ایرانی ۹۹ درصد بود. درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده به روش نزدیک ترین همسایه با استفاده از ترادف نوکلئوتیدی ناحیه تکثیر شده نشان داد که تمامی جدایه های CYSDV در یک گروه قرار گرفته و جدایه های بوشهر، خوزستان و تهران در زیر گروه مجزا نسبت به سایر جدایه های مورد بررسی قرار گرفتند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
طیبه کشاورز
استادیار موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
کاوه بنانج
استاد موسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :