ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

ساختار ژنتیکی جمعیت های Fusarium verticillioides عامل پوسیدگی ریشه و طوقه برنج در استان ایلام با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره ای (مقاله ی انگلیسی)

محل انتشار: مجله آفات و بیماریهای گیاهی، دوره: 83، شماره: 2
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 99

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1517143

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAEN-83-2_020

تاریخ نمایه سازی: 23 شهریور 1401

چکیده مقاله:

مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت­های  Fusarium verticillioides اطلاعات مختلفی از مدیریت بیماری پوسیدگی ریشه در مزارع برنج را فراهم می­کند. نشانگرهای SSR برای تعیین ساختار ژنتیکی و تخمین تنوع ژنتیکی در ۳۹ جدایهF. verticillioides  از پنج منطقه مختلف از جمله: تنگه قیر، لومار، شیروان، سرابله و دره شهر در استان ایلام استفاده شد. میانگین آلل­ها در هرمکان ژنی ۵/۲ آلل بود و و تعداد آلل­ها در جمعیت­ها از جمله جمعیت لومار با تعداد ۱۳ آلل بیش­ترین آلل و جمعیت­های تنگه قیر و دره شهر با نه آلل به­عنوان کم­ترین تعداد آلل را دارا بودند. تعداد آلل­های مشاهده شده(Na) و تعداد آلل­های موثر (Ne) در لومار (۱/۲۷۶= Ne : ۱= Na) نسبت به دیگر جمعیت­ها بیش­تر بودند. تنوع ژنتیکی (H) و شاخص شانون (I) در لومار بالا بود) ۰/۱۶۷ =He  ۰/۲۵۴ = I  (اما مقدار آنها در دره شهر کم­تر بود) ۰/۱۴۱ =He   ۰/۲۰۴ = I). کم­ترین فاصله ژنتیکی بین تنگه ­قیر و لومار و بعد شیروان مشاهده شد و بیش­ترین فاصله ژنتیکی بین دره شهر و تنگ قیر (۰/۰۱۸) وجود داشت. تنوع ژنتیکی کل(Ht)  و تنوع ژنی بین زیر جمعیت­ها (Hs) ۰/۱۲۵ و ۰/۱۱۶ به­ترتیب تخمین زده شد. تنوع ژنتیکی موثر در تمایز بین جمعیت­ها (Gst) ۰/۰۷۲ بود و میزان جریان ژنی(Nm) ۶/۳۶۸ بود. تجزیه کلاستر براساس UPGMA نشان داد که بین تنگه قیر و لومار و سپس شیروان کم­ترین فاصله ژنتیکی وجود دارد و دندروگرام فاصله ژنتیکی بالایی بین دره شهر و چهار جمعیت دیگر را نشان می­دهد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

خشنود نوراللهی

استادیار بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی دانشگاه ایلام

زینب حقی

دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی دانشگاه ایلام

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • AMOAH, B. K., MACDONALD, M. V., REZANOOR, H. N. and ...
  • AMOAH, B. K., REZANOOR, H. N., NICHOLSON, P. and MACDONALD, ...
  • BAYRAKTAR, H. ۲۰۱۰. Genetic diversity and population structure of Fusarium ...
  • BOOTH, C. ۱۹۷۱. The genus Fusarium. Common wealth Mycological Institute: ...
  • BRITZ, H. C., COUTINHO, T. A., WINGFIELD, B. D. and ...
  • BURGESS, L. W., SUMMERELL, B. A., BACKHOUSE, D., BENYON, F. ...
  • BURGESS, T., WING, M. and WING, B. ۲۰۰۱. Simple sequence ...
  • CHEN, Y., WANG, J. X., ZHOU, M. G., CHEN, C. ...
  • DARVISHNIA, M., ALIZADEH, A., ZAREA, R. and MOHAMMADI GOLTAPEH, E. ...
  • DATTA, S., CHOUDHARY, R. G., SHAMIM, M. D., SINGH, R. ...
  • DESJARDINS, A. E., MANANDHAR, H. K., PLATTNER, R. D., MANANDHAR, ...
  • DOYLE, J. J. and DOYLE, J. L. ۱۹۹۰. A rapid ...
  • EBADI, M., RIAHI, H. and ARE, R. ۲۰۱۳. Genetic diversity ...
  • HSIEH, H. W., SMITH, S. N. and SNYDER, W. C. ...
  • HUSS, M. J., CAMPBELL, C. L., JENNINGS, D. B. and ...
  • JO, Y. K., CHANG, S. W., REES, J. and JUNG, ...
  • KELLER, S. M., MCDERMOTT, J. M., PETTWAY, R. E., WOLFE, ...
  • KENDRICK, B. ۲۰۰۳. Analysis of morphogenesis in hyphomycetes: new characters ...
  • KOSMAN, E. and LEONARD, J. ۲۰۰۵. Similarity coefficients for molecular ...
  • LESLIE, J. F. ۱۹۹۱. Mating populations in Gibberella fujikuroi (Fusarium ...
  • LESLIE, J. F. ۱۹۹۳. Fungal vegetative compatibility. Annual Review of ...
  • LESLIE, J. F. ۱۹۹۵. Gibberella fujikuroi: available populations and variable ...
  • LESLIE, J. F. and SUMMERELL, B. A. ۲۰۰۶. The Fusarium ...
  • LESLIE, J. F., PEARSON, C. A., NELSON, P. A. and ...
  • LI, Y. C., KOROL, A. B., FAHIMA, T., BEILES, A. ...
  • MCDERMOT, J. M. and MCDONALD, B. A. ۱۹۹۳. Gene flow ...
  • MCDONALD, B. A. ۲۰۰۴. Population genetics of plant pathogens. The ...
  • MCDONALD, B. A. and MCDERMOTT, J. M. ۱۹۹۳. Population genetics ...
  • MITTER, N., SRIVASTAVA, A. C., AHMAD, R. S., SARBOY, A. ...
  • NEI, M. ۱۹۷۳. Analysis of the genetic diversity in subdivided ...
  • NEI, M. and LI, W. H. ۱۹۷۹. Mathematical Model for ...
  • NELSON, P. E., TOUSSOUN, T. A. and COOK, R. J. ...
  • NELSON, P. E., TOUSSOUN, T. A. and MARASAS, W. ۱۹۸۳. ...
  • NIRENBERG, H. I. ۱۹۸۱. A simplified method for identifying Fusarium ...
  • NYVALL, R. F. ۱۹۹۹. Field crop diseases. Iowa State University ...
  • ODONNELL, K., CIGENLINK, E. and NIRENBERG, H. I. ۲۰۰۰. Molecular ...
  • PEAKALL, R. and SMOUSE, P. E. ۲۰۱۲. GenAlEx ۶.۵: genetic ...
  • REN, X., ZHU, Z. D., LI, H. J., DUAN, C. ...
  • ROLDAN-RUIZ, I., DENDAUW, J. E., VAN BOCKSTAELE, E., DEPICKER, A. ...
  • ROLHF, F. J. ۱۹۹۰. NTSYSPc, Numerical taxonomy and multivariant analysis ...
  • SAHARAN, M. S. and NAEF, A. ۲۰۰۸. Detection of genetic ...
  • SAREMI, H. ۲۰۰۰. Plant diseases caused by Fusarium species. ۱st ...
  • SHAH, D., BERGSTROM, G. C. and UENG, P. P. ۱۹۹۵. ...
  • SLIPPERS, B., BURGESS, T., WINGFIELD, B. D., CROUS, P. W., ...
  • SNEATH, P. H. A. and SOKAL, P. R. ۱۹۷۳. Numerical ...
  • TAHERKHANI, K., ALIZADEH, A., FAROKHINEJAD, R. and SHARIFITEHRANI, A. ۱۹۹۸. ...
  • TENZER, I., IVANISSEVICH, S. D., MORGANTE, M. and GESSLER, C.۱۹۹۹. ...
  • VARSHNEY, R. K., CHABANE, K., HENDRE, P. S., AGGARWAL, R. ...
  • VOIGT, K., SCHLEIER, S. and BRUCKNER, B. ۱۹۹۵. Genetic variability ...
  • WEISING, K., KAEMMER, D., EPPLEN, J. T., WEIGAND, F., SAXENA, ...
  • WHITE, D. G. ۱۹۹۹. Compendium of Corn diseases. ۳rd Ed. ...
  • WOSTEMEYER, J. and KREIBICH, A. ۲۰۰۲. Repetitive DNA elements in ...
  • XU, J. R. and LESLIE, J. F. ۱۹۹۶. A genetic ...
  • YEH, F. C., YANG, R. C. and BOYLE, T. ۱۹۹۹. ...
    • نمایش کامل مراجع