مقایسه کاریولوژیکی بین اکوتیپ های سیر (Allium sativum) بومی ایران با نمونه های خارجی

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 130

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-14-3_002

تاریخ نمایه سازی: 11 مهر 1401

چکیده مقاله:

هدف: اولین قدم در شناخت ژنوم یک گونه، مطالعه تعداد و شکل کروموزوم های آن است. در تعیین روابط خویشاوندی بین گونه های یک جنس، صفاتی از قبیل مورفولوژی کروموزوم ها، اندازه مطلق کروموزوم ها، موقعیت سانترومرها، عدد پایه کروموزومی و تعداد ماهواره ها مورد بررسی قرار می گیرد. هدف این پژوهش بررسی تنوع سیتوژنتیکی و تعیین روابط خویشاوندی بین اکوتیپ های سیر بومی ایران با چند نمونه خارجی و تجزیه و تحلیل ژنوم براساس اطلاعات کروموزومی و مقایسه نتایج حاصل از بررسی قرابت و نزدیکی اکوتیپ ها براساس اطلاعات کاریوتایپی است. مواد و روش ها: ۸ اکوتیپ سیر شامل: شهرهای بجنورد، شاهرود، مشهد، بیرجند، تالش و از کشورهای آذربایجان، ارمنستان و تاجیکستان جمع آوری شد، از سلول های میتوزی مریستم انتهایی ریشه در مرحله متافاز و رنگ آمیزی با  استواورسئین استفاده شد، تعداد پنج سلول متافازی مناسب انتخاب و با استفاده از نرم افزار Karyotype Analysis (۱.۵)طول بازوهای کوتاه و بلندکروموزوم و طول کل کروموزوم ها اندازه گیری و سایر شاخص ها نظیر شکل کلی کاریوتایپ، شاخص سانترومری، شاخص نامتقارن بودن درون کروموزومی، شاخص نامتقارن بودن بین کروموزومی، شاخص تقارن کاریوتایپ، ضریب عدم تقارن، انحراف معیار طول کروموزوم، انحراف معیار شاخص سانترومری محاسبه شد. داده ها در نرم افزارآماری JMP۸ در قالب طرح کاملا تصادفی نامتعادل تجزیه و تحلیل شدند. مقایسه میانگین به روش دانکن  انجام شد و تجزیه خوشه ای به روش Ward صورت پذیرفت. نتایج: نتایج نشان داد عدد پایه کروموزومی در اکوتیپ های ترکمنستان و بجنورد x=۷، ۲n=۲x=۱۴ و در سایر اکوتیپ هاx=۸ ،   ۲n=۲x=۱۶است و اختلاف معنی داری (P<۰.۰۱) بین طول بازوی کوتاه، طول بازوی بلند، طول کل کروموزوم مشاهده شد. در تجزیه خوشه ای مشخص شد کمترین فاصله اقلیدسی مربوط به دو اکوتیپ کشورآذربایجان و شهر تالش است. کوچکترین کروموزوم ها مربوط به اکوتیپ مشهد و بزرگترین کروموزوم ها مربوط به شاهرود است. متقارن ترین کاریوتایپ اکوتیپ آذربایجان و نامتقارن ترین کاریوتایپ شاهرود بود. نتیجه گیری: یافته ها نشان داد اختلاف در تعداد کروموزوم ها می تواند به علت تغییرات رابرتسونین باشد و به نظر می رسد اکوتیپ های ۲n=۲x=۱۴ قدمت بیشتری دارند و اکوتیپ های ۱۶ کروموزومی از آنها بوجود آمده اند. با توجه به اینکه در اکوتیپ بجنورد ۱۴ کروموزوم مشاهده شد، می توان قدمت منشا این گیاه را در این منطقه از ایران تایید کرد. همچنین کروموزوم ها از نظر اندازه و محل قرارگیری سانترومر با یکدیگر تفاوت دارند که این تفاوت به علت شکست کروموزومی و ایجاد ساختار جدید، در دوباره بهم متصل شدن آن ها است. این تحقیق نشان داد نژادهای دور در میان اکوتیپ های مورد بررسی کدامند و امکان انجام تحقیقات برای تهیه هیبریدهای احتمالی بعدی در کدام مسیر، امکان موفقیت بیشتری را فراهم می کند.

کلیدواژه ها:

تجزیه خوشه ای ، تنوع کروموزومی ، سیر ، تجزیه و تحلیل کاریوتایپ

نویسندگان

الهام یعقوبی

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، ایران

سعید ملک زاده شفارودی

دانشیار گروه بیوتکولوژی و اصلاح نباتات- دانشکده کشاورزی- دانشگاه فردوسی مشهد

محمد فارسی

استاد اصلاح نباتات، گروه بیوتکنولوژی وبه نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد،

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • حسام زاده حجازی سیدمحسن، ضیایی نسب مهدی (۱۳۸۵) بررسی کاریولوژیکی ...
  • عالیشاه عمران، امیدی منصور (۱۳۸۷) روشهای آزمایشگاهی سیتوژنتیک گیاهی. انتشارات ...
  • یعقوبی الهام، ملک زاده شفارودی سعید (۱۳۹۲) بررسی تنوع ژنتیکی ...
  • ReferencesAlishah O, Omidi M (۲۰۰۸) Laboratory methods in cytogenetics, Tehran ...
  • Banerjee N (۱۹۸۰) Chromosome studies in some species of Allium. ...
  • Bauchan G R, Hossain M A (۱۹۹۸) Karyotypic analysis of ...
  • Cortes F, Gonzalez-Gil G, Hazen, M J (۱۹۸۳) C-banding and ...
  • Cortes F, Escalza P (۱۹۸۶) Analysis of different banding patterns ...
  • Donsakul T, Phornphisutthimas S (۲۰۱۰) Karyotypes of six species in ...
  • Farsi M, Ghaboli M, Mahmoudnia M (۲۰۱۰) Plant Cytogenetics. Ferdowsi ...
  • Levan A (۱۹۳۵) Cytological studies in Allium, VI the chromosome ...
  • Oroji Salmasi K, Javadi H, Miri S M (۲۰۱۹) Karyotype ...
  • Peruzzi L, Leitch I J, Caparelli K F (۲۰۰۹) Chromosome ...
  • Mollafilabi A, Hosseini M, Moosapour S (۲۰۰۵) Garlic agronomy (Allium ...
  • Didactic Issue of Jihad, Iran. (In Persian)Saensouk S, Saensouk P ...
  • Stebbins GL (۱۹۷۱) Chromosomal Evolution in Higher Plants. Addison Wesley ...
  • Wajahatullah MK,Vahidy AA (۱۹۹۰) Karyotyping and localization of nucleolarorganizer regions ...
  • Yaghoobi E, Malekzadeh-Shafarodi S (۲۰۱۴) Genetic variation of Iranian ecotypes ...
  • نمایش کامل مراجع