مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراج شده توس کیت برای ردیابی ژن هایOPrL ،ExoA ، algDدر ایزوله های بالینی سودوموناس آئروژینوزا

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 175

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_MUQ-11-3_002

تاریخ نمایه سازی: 21 مهر 1401

چکیده مقاله:

زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا، یکی از رایج ترین عوامل عفونت های بیمارستانی محسوب می شود. بیشتر آزمایشگاه ها به طور معمول برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا، از روش کشت و تست های بیوشیمیایی مختلف استفاده می کنند که روشی وقت گیر بوده و در برخی موارد دارای نتایج مثبت و منفی کاذب می باشد. هدف از انجام این پژوهش مقایسه دو روش مولکولی PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت و PCR با استفاده از کلنی مستقیم در تشخیص ایزوله های سودوموناس آئروژینوزا بود. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی – تحلیلی، از ۳۹۵ ایزوله بالینی مختلف، ۸۵ ایزوله با تست های بیوشیمیایی اولیه و کشت بر روی محیط های اختصاصی سودوموناس آئروژینوزا تشخیص داده شدند. سپس با استفاده از ژن های OPrL،ExoA ، algD با دو روش مولکولی PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت، مورد ارزیابی قرار گرفتند. یافته ها: از مجموع ۸۵ ایزوله سودوموناس آئروژینوزا که به روش فنوتیپی، غربالگری شده بودند، ۸۱ ایزوله به روش PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت، حاوی ژن های OPrL، ExoA، algD (با طول نوکلئوتیدهای ۵۰۴، ۳۹۶ و ۵۲۶ جفت باز) و۸۰ ایزوله نیز به روش PCR مستقیم، دارای ژن های مذکور بودند. نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نشان داد بدون استفاده از کیت های استخراج می توان به نتایج تشخیصی قابل قبول در شناسایی سودوموناس آئروزینوزا دست یافت. از طرفی، در نتایج به دست آمده می توان خطای روش های تشخیصی فنوتیپی سودوموناس آئروژینوزا را مشاهده کرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

حامد طهماسبی

۱Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran

جواد ادبی

۱Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran

شهرام شهرکی زاهدانی

۲Infectious Diseases & Tropical Medicine Research Center, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran.

بهروز زینی

Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Kang CI, Kim SH, Kim HB, Park SW, Choe YJ, ...
  • Hauser AR, Rello J. Severe infections caused by Pseudomonas aeruginosa. ...
  • Govan JR, Deretic V. Microbial pathogenesis in cystic fibrosis: Mucoid ...
  • Lyczak JB, Cannon CL, Pier GB. Establishment of Pseudomonas aeruginosa ...
  • Marra AR, Pereira CAP, Gales AC, Menezes LC, Cal RG, ...
  • Yousefi Mashouf R, Esmaeili R, Alikhani MY, Ghanbari M. Evaluation ...
  • Park JY, Fox LK, Seo KS, McGuire MA, Park YH, ...
  • Zadoks RN, Watts JL. Species identification of coagulase-negative staphylococci: Genotyping ...
  • Andreson R, Reppo E, Kaplinski L, Remm M. GENOMEMASKER package ...
  • Walley AJ. PCR Protocols current methods and applications. J Med ...
  • Innis M, Gelfand D. ۱ - Optimization of PCR: Conversations ...
  • Rychlik W. Selection of primers for polymerase chain reaction. Methods ...
  • Shahbazi B, Narenji H. Comparison of four methods of DNA ...
  • Capoluongo E, Giglio AA, Lavieri MM, Lesnoni-La Parola I, Ferraro ...
  • Borst P. Genetic Mechanisms of drug resistance: A review. Acta ...
  • Montazeri EA, Khosravi AD, Jolodar A, Ghaderpanah M, Azarpira S. ...
  • Quirk M. First VRSA isolate identified in USA. Lancet Infect ...
  • Ahsani MR, Shamsodinbafti M. Compare of two methods of direct ...
  • Lichtensteiger CA, Steenbergen SM, Lee RM, Polson DD, Vimr ER. ...
  • Nakao H, Popovic T. Development of a direct PCR assay ...
  • Fode-Vaughan KA, Maki JS, Benson JA, Collins ML. Direct PCR ...
  • Inglis GD, Kalischuk LD. Use of PCR for direct detection ...
  • van Hal SJ, Stark D, Lockwood B, Marriott D, Harkness ...
  • Nishimura N, Nakayama H, Yoshizumi S, Miyoshi M, Tonoike H, ...
  • نمایش کامل مراجع