Investigation of phylogenetic relationships and genetic diversity of Seidlitzia rosmarinus populations by ISSR marker in some regions of Iran

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 132

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ROST-22-1_002

تاریخ نمایه سازی: 23 مهر 1401

چکیده مقاله:

The genus Seidlitzia has four herbaceous species viz. S. florida (M.B.) Bge. ex Boiss., S. cinerea (Moq.) Bge. ex Botsch. and S. stokii that are herbaceous, and S. rosmarinus (Ehrenb.) Bge. ex Boiss. is shrubby belong to the family Amaranthaceae. In the present study, ISSR molecular markers were used to evaluate the genetic diversity among ۸۵ plant samples from ۱۷ populations of S. rosmarinus. Four random primers were used to perform ISSR reactions and in total ۲۲۱ DNA bands were obtained. After forming ۰ and ۱ matrix with the help of GenAlex and NTSYS software, it was used to interpret ISSR analysis data. Molecular analysis of variance (AMOVA) was performed to estimate genetic diversity out of ۸۵ individuals. Of total diversity, the highest amount of genetic diversity (۶۸%) was related to intra-population diversity, ۲۸% of inter-population diversity, and ۴% of inter areas was calculated. MCMC analysis using Structure ۲.۳.۴ software was used to investigate the genetic diversity populations of S. rosmarinus. Main coordinates analysis by the PCOA method was also used for extract maximum information from molecular data.  

کلیدواژه ها:

Amaranthaceae ، cluster analysis ، molecular analysis of variance ، UPGMA method

نویسندگان

شیما صدیقی

PhD Student, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

علیرضا ایرانبخش

Prof., Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

سیدمهدی حمدی

Associate Prof., Department of Biology, Central Tehran Branch, Slamic Azad University, Tehran, Iran

ایرج مهرگان

Associate Prof., Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Assadi, M. ۲۰۰۱. Chenopodiaceae. Pp. ۲۷–۶۵. In: Assadi, M. (ed.), ...
  • APG IV. ۲۰۱۶. An update of the Angiosperm phylogeny group ...
  • Baghestani, A. & Maybodi, N. ۱۹۹۶. The effect of pruning ...
  • Bhatt, A., Bhatt, N.R. & Marutimuttil, T. ۲۰۱۹. Germination behavior ...
  • Boissier, E. ۱۸۷۹. Chenopodium L. In: Flora Orientalis ۴. Genevae ...
  • Godwin, I.D., Aitken, E.A. & Smith, L.W. ۱۹۹۷. Application of ...
  • Hadi, M.R., Taheri, R. & Sharif, M.S. ۲۰۰۷. Study effects ...
  • Hadi, M. ۲۰۰۹. Biotechnological potentials of Seidlitzia rosmarinus. African Journal ...
  • Hayder, S.Z. & Yasmin, S. ۱۹۷۲. Salt tolerance and cation ...
  • Hedge, I.C., Akhani, H., Freitag, H., Kother-Heinrich, G., Podlech, D., ...
  • Huelsenbeck, J.P. & Ronquist, F. ۲۰۰۱. MrBayes: Bayesian Inference of ...
  • Iranbakhsh A.R., Hamdi, S.M.M. & Assadi M. ۲۰۰۸. Flora, life ...
  • Kantety, R.V., Zeng, X., Bennetzen, J.L. & Zehr, B.E. ۱۹۹۵. ...
  • Karimi, M., Pormajidian, M.R., Jalilvand, H. & Safari, A. ۲۰۱۲. ...
  • Khavazeh, M. ۱۹۹۹. Effect of Salinity on Germination, Growth and ...
  • Latifi, J. ۱۹۹۸. Siedlitzia rosmarinus, a suitable plant for desertification ...
  • Maddison, W.P. & Maddison, D.R. ۲۰۰۲. MacClade: Analysis of Phylogeny ...
  • Mousavi Kouhi, S.M., Moudi, M., Soltani Moghadam, E. & Sarchahi ...
  • Kianian, M.K., Ravanbakhsh, H., Ara, H. & Nikou, Sh. ۲۰۱۹. ...
  • Sabeti, H. ۱۹۹۴. Forests, Trees and Shrubs of Iran. University ...
  • Salimath, S.S., Oliveira, A., Bennetzen, J.L. & Godwin, I.D. ۱۹۹۵. ...
  • Yang, C., Everitt, J.H., Bradford, J.M. & Escobar, D.E. ۲۰۰۰. ...
  • نمایش کامل مراجع