پیش بینی درون رایانه ای اپی توپ های سلول B پروتئین همراه با همولیز- ۱ برای طراحی واکسن علیه لپتوسپیروز

لپتوسپیروز به عنوان یک بیماری مشترک انسان و دام از اهمیت جهانی برخوردار است. این بیماری ناشی از عفونت باکتری لپتوسپیرا می باشد،اگرچه چندین واک سن برای لپتو سپیروز تا کنون آزمایش شده ا ست اما علیرغم ده ها سال تحقیق واک سینا سیون در مرحله ی بالینی ناموفق بودهاست. از این رو این مطالعه با هدف پیش بینی اپی توپ سلول های B با پروتئین همراه با همولیز-۱ (Hap۱) برای طراحی واکسن علیه لپتوسپیروزانجام شد. برای پیش بینی اپی توپ های خطی، دنباله ی ناحیه خارج- سلولی Hap۱ به سرورهای Bepipred ، ABCpred ، BCPREDs ،Bcepred و Ellipro ارسال شد. سرورهای DiscoTope ۲.۰ و B-pred برای برای پیش بینی اپی توپ های سازنده از کل ساختار PDB Hap۱ که از روش مدل سازی همسانی بدست آمده استفاده شده است. تجزیه و تحلیل بیشتر برای مناطق قابل دسترسی با حلال و دسترسی نسیحلال به کلیه باقیمانده های موجود در سازه های PDB با استفاده از برنامه Naccess و سرور NetSurfP تعریف کردند که اپی توپ هایسلول های سازگار پیش بینی شده حلال بالاتری دارند و باقیمانده های آنها روی سطح قرار می گیرند بنابراین، تجزیه و تحلیل ایمونوژنتیک نشانداد که پروتئین ۱ همراه با همولیز می تواند به درستی پاسخ های ایمنی سلولهای B را تحریک کند.