طراحی یک سازه جدید واکسن مولتی اپی توپ پپتیدی علیه SARS-CoV-۲ با استفاده از ابزار ایمونوانفورماتیک

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 221

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_DMED-30-4_003

تاریخ نمایه سازی: 22 آبان 1401

چکیده مقاله:

مقدمه و هدف: ویروس سندرم تنفسی حاد کرونا ویروس (SARS-CoV-۲) برای اولین بار در چین ظهور پیدا کرد و به سرعت در سراسر جهان منتشر شد. به دلیل شیوع گسترده آن در سراسر جهان تلاش برای ارائه واکسن موثر و ایمن علیه این ویروس ضروری می باشد. ژنوم این ویروس دارای مولکول RNA تک رشته ای می باشد که کدکننده چهار پروتئین ساختاری متفاوت می باشد، از میان آنها، پروتئین های اسپایک (S) و نوکلئوکپسید ویروس (N) نقش بسزایی در تحریک سیستم ایمنی در جهت مقابله با ویروس را دارند. واکسن های مولتی اپی توپ پپتیدی که شامل اپی توپ های ایمنی زای سلول های T و B هستند، به دلیل اختصاصیت بالا در سال های اخیر بسیار مورد توجه واقع شده اند. این واکسن ها با استفاده از ابزار ایمونوانفورماتیک طراحی می شوند.مواد و روش ها: در این پژوهش پروتئین های S و N  SARS-CoV-۲ با کمک سرورهای بیوانفورماتیک به منظور شناسایی اپی توپ های سلول های T CD۴ و B آنالیز شدند. از زیر واحد B توکسین کلرا و اپی توپ PADRE به عنوان ادجوانت استفاده شد. اجزای مذکور با لینکرهای پپتیدی به هم متصل شدند و ویژگی های سازه واکسن طراحی شده از جمله آنتی ژنیسیته، عدم آلرژنیسیته، خصوصیات فیزیکی و شیمیایی، ساختار دوم و سوم با استفاده از سرورهای بیوانفورماتیک پیشگویی شد.نتایج: براساس نتایج آنالیزهای بیوانفورماتیک سازه مذکور دارای آنتی ژنیسیته بالا بوده و آلرژن نیز نمی باشد.نتیجه گیری: بنابراین سازه طراحی شده به عنوان یک کاندید واکسن مناسب علیه            SARS-CoV-۲ می تواند مورد بررسی قرار گیرد، هر چند انجام مطالعات آزمایشگاهی ضروری می باشد.

کلیدواژه ها:

ویروس سندرم تنفسی حاد کرونا ، واکسن ، ایمونوانفورماتیک ، اسپایک ، نوکلئوکپسید

نویسندگان

شیرین محمودی

گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده علوم نوین پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی فسا، فسا، فارس، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Wibawa T. COVID‐۱۹ vaccine research and development: ethical issues. Tropical ...
  • Su S, Du L, Jiang S. Learning from the past: ...
  • Sharma O, Sultan AA, Ding H, Triggle CR. A Review ...
  • Singh S, Singh R, Singh K, Singh V, Malik Y, ...
  • Shen M, Zhou Y, Ye J, Al-Maskri AAA, Kang Y, ...
  • Muhammad S, Long X, Salman M. COVID-۱۹ pandemic and environmental ...
  • He J, Tao H, Yan Y, Huang S-Y, Xiao Y. ...
  • Das O, Neisiany RE, Capezza AJ, Hedenqvist MS, Försth M, ...
  • Saadat S, Rawtani D, Hussain CM. Environmental perspective of COVID-۱۹. ...
  • Velavan TP, Meyer CG. The COVID‐۱۹ epidemic. Tropical Medicine & ...
  • Heller L, Mota CR, Greco DB. COVID-۱۹ faecal-oral transmission: Are ...
  • Mohammed M, Syamsudin H, Al-Zubaidi S, AKS RR, Yusuf E. ...
  • Horowitz RI, Freeman PR. Three novel prevention, diagnostic, and treatment ...
  • Koirala A, Joo YJ, Khatami A, Chiu C, Britton PN. ...
  • McIntosh K, Hirsch M, Bloom A. Coronavirus disease ۲۰۱۹ (COVID-۱۹): ...
  • Scarabel L, Guardascione M, Dal Bo M, Toffoli G. Pharmacological ...
  • Stratmann T. Cholera toxin subunit B as adjuvant––an accelerator in ...
  • Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, ...
  • Rueckert C, Guzmán CA. Vaccines: from empirical development to rational ...
  • Sanami S, Zandi M, Pourhossein B, Mobini G-R, Safaei M, ...
  • Naz A, Shahid F, Butt TT, Awan FM, Ali A, ...
  • Kumar J, Qureshi R, Sagurthi SR, Qureshi IA. Designing of ...
  • McBride R, Van Zyl M, Fielding BC. The coronavirus nucleocapsid ...
  • Alexander J, Fikes J, Hoffman S, Franke E, Sacci J, ...
  • Panina‐Bordignon P, Tan A, Termijtelen A, Demotz S, Corradin G, ...
  • Del Guercio M-F, Alexander J, Kubo RT, Arrhenius T, Maewal ...
  • Safavi A, Kefayat A, Mahdevar E, Abiri A, Ghahremani F. ...
  • Consortium U. UniProt: a worldwide hub of protein knowledge. Nucleic ...
  • Vita R, Mahajan S, Overton JA, Dhanda SK, Martini S, ...
  • Saha S, Raghava GPS. Prediction of continuous B‐cell epitopes in ...
  • Jespersen MC, Peters B, Nielsen M, Marcatili P. BepiPred-۲.۰: improving ...
  • Magnan CN, Zeller M, Kayala MA, Vigil A, Randall A, ...
  • Doytchinova IA, Flower DR. VaxiJen: a server for prediction of ...
  • Saha S, Raghava G. AlgPred: prediction of allergenic proteins and ...
  • Patra P, Bhattacharya M, Sharma AR, Ghosh P, Sharma G, ...
  • Magnan CN, Randall A, Baldi P. SOLpro: accurate sequence-based prediction ...
  • Gasteiger E, Hoogland C, Gattiker A, Wilkins MR, Appel RD, ...
  • Deléage G. ALIGNSEC: viewing protein secondary structure predictions within large ...
  • Yang J, Yan R, Roy A, Xu D, Poisson J, ...
  • Grote A, Hiller K, Scheer M, Münch R, Nörtemann B, ...
  • Ahmad S, Navid A, Farid R, Abbas G, Ahmad F, ...
  • Yamaoka Y, Miyakawa K, Jeremiah SS, Funabashi R, Okudela K, ...
  • Farhani I, Nezafat N, Mahmoodi S. Designing a novel multi-epitope ...
  • Ayyagari VS, TC V, Srirama K. Design of a multi-epitope-based ...
  • Yazdani Z, Rafiei A, Yazdani M, Valadan R. Design an ...
  • Rosa DS, Tzelepis F, Cunha MG, Soares IS, Rodrigues MM. ...
  • Rahman N, Ali F, Basharat Z, Shehroz M, Khan MK, ...
  • Heggestad JT, Kinnamon DS, Olson LB, Liu J, Kelly G, ...
  • Zhang B-z, Hu Y-f, Chen L-l, Yau T, Tong Y-g, ...
  • Li Y, Lai D-y, Zhang H-n, Jiang H-w, Tian X, ...
  • نمایش کامل مراجع