مطالعه پویش ژنومی و آنالیز مسیرهای زیستی برای شناسایی ژن های موثر بر رنگ پوشش در گوسفندان لری-بختیاری

رنگ پوشش، یکی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند بوده و همچنین می تواند در شناسایی و تعیین خصوصیات نژادی مورد استفاده قرار گیرد. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم و آنالیز مسیرهای زیستی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی­سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه­ها و ژن های مرتبط با صفت رنگ پوشش گوسفندان لری-بختیاری بوده است. پویش کل ژنوم بر اساس روش مورد-شاهدی در برنامه PLINK نسخه ۹۰/۱ انجام شد. آنالیز غنی­سازی مجموعه ژنی با بسته نرم­افزاری goseq برنامه R نسخه ۱/۶/۳ با هدف شناسایی سطوح عملکردی و مسیرهای زیستی ژن های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای آنالیز بیوانفورماتیکی از پایگاه­های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. در این پژوهش نشانگر تک نوکلئوتیدی معنی­دار روی کروموزوم­های ۱، ۲، ۶، ۹، ۱۰­ و ۱۶ شناسایی شدند که با ژن های EDNRB، PDGFRA، TCF۲۵ و TYRP۱ مرتبط بودند. در آنالیز غنی­سازی مجموعه ژنی تعداد ۵ مسیر هستی­شناسی ژنی با صفت رنگ پوشش مرتبط بودند (۰۵/۰P<). از این بین، مسیرهای Regulation of protein tyrosine kinase activity، Regulation of protein kinase A signaling وActivation of protein kinase activity نقش مهمی در رشد و توسعه ملانوسیت­ها و تنظیم رنگدانه ­ها در بدن داشتند. با توجه به تایید ارتباط برخی از مناطق ژنومی شناسایی شده در تحقیق حاضر با رنگ پوشش در گوسفند و بعضی گونه­های دیگر و همچنین شناسایی مناطق ژنومی جدید، ژن های شناسایی شده در این مطالعه می­توانند به عنوان ژن های کاندیدا برای مطالعات تکمیلی و نهایتا در انتخاب ژنتیکی رنگ پوشش در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.