مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش با استفاده از نشانگرهای مولکولی

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 203

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARGU-11-3_003

تاریخ نمایه سازی: 17 بهمن 1401

چکیده مقاله:

در این تحقیق جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش، تعداد ۷۵ نمونه خون از محل پراکنش این حیوانات جمع­آوری شد. استخراج DNA با روش بهینه یافته Salting-Out انجام گرفت. تعداد ۱۰ جایگاه ریزماهواره و یک ناحیه کنترلی D-Loop مربوط به DNA میتوکندریایی (mtDNA) مورد مطالعه قرار گرفت. برای تکثیر جایگاه­های ریزماهواره از یک PCR چندگانه استفاده شد. آغازگرهای انتخابی نشان­دار شده و  با استفاده از دستگاه Genetic Analyser تعیین ژنوتیپ افراد انجام گرفت. در مجموع، ۸۴ آلل در جمعیت مورد مطالعه شناسایی شد، لذا متوسط تعداد آلل به ازای هر نشانگر برابر با ۴/۸ بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و هتروزیگوسیتی مشاهده شده در این جمعیت به ترتیب برابر با ۰۴۲/۰±۷۲۴/۰ و ۰۵۸/۰±۸۰/۰ بود. مقدار FIS در این جمعیت برابر با  ۱۰۸/۰-  بود که نشان­دهنده غیرهمخون بودن و وجود تنوع قابل توجه در این جمعیت است. نتایج حاصل از ناحیه کنترلی mtDNA نشان داد که میزان تنوع هاپلوتیپی و درصد جایگاه­های چندشکل در این جمعیت به ترتیب ۰۳۹/۰±۹۳۸/۰ و ۵۹/۴ است. از مجموع ۲۴ نمونه تعیین توالی شده در ناحیه کنترلی mtDNA، تعداد ۱۷ هاپلوتیپ در جمعیت مورد مطالعه مشخص شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی در جمعیت شین بش، ۰۰۱۳/۰±۰۱۳۱/۰ به ازای هر جایگاه به­دست آمد. نتایج این تحقیق نشان داد که ۵۰ درصد از افراد جمعیت شین بش دارای هاپلوگروه A، ۲/۲۹ درصد افراد دارای هاپلوگروه B و ۸/۲۰ درصد افراد دارای هاپلوگروه C هستند.

نویسندگان

علی جوانروح

استادیار، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

صلاح الدین خدامرادی

استادیار، گروه علوم دامی، واحد مهاباد، دانشگاه آزاد اسلامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Al-Atiyat R. M., Aljumaah R. S., Alshaikh M. A. and ...
  • Angelo F. D., Albenzio M., Sevi A., Ciampolini R., Cecchi ...
  • Barker J. S. F. ۲۰۰۱. Conservation and management of genetic ...
  • Beuzen N. D., Stear M. J. and Chang K. C. ...
  • Boratyn G. M., Schäffer A. A., Agarwala R., Altschul S. ...
  • Chen S. Y., Duan Z. Y., Sha T., Xiangyu J., ...
  • Dudu A., Popa G. O., Ghiță E., Pelmuș R., Lazăr ...
  • El Nahas S., Hassan A., Abou Mossallam A., Mahfouz E., ...
  • FAO. ۲۰۰۷. The State of the world’s animal genetic resources ...
  • FAO. ۲۰۱۱. Guideline on molecular genetic characterization of animal genetic ...
  • Ferreira J. S., Paiva S. R., Silva E. C., McManus ...
  • Groeneveld L. F. Lenstra J. A. Eding H. Toro M. ...
  • Hall T. A. ۱۹۹۹. BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment ...
  • Hedrick P. W. ۲۰۰۰. Genetics of populations. ۲nd Edition, Jones ...
  • Javanrouh A. ۲۰۱۳. Determination of genetic relationships of Shin Bash ...
  • Kumar S., Stecher G. and Tamura K. ۲۰۱۶. MEGA۷: Molecular ...
  • Ladoukakis E. D. and Zouros E. ۲۰۱۷. Evolution and inheritance ...
  • Liu J., Ding X., Zeng Y., Yue Y., Guo X., ...
  • Lv F. H., Peng W. F., Yang J., Zhao Y. ...
  • Machová K., Málková A. and Vostrý L. ۲۰۲۲. Sheep post-domestication ...
  • Molaei V., Asfouri R., Eskandari Nasab M. P., Ghanbari P. ...
  • Mukhametzharova I., Islamov Y., Shauyenov S., Ibrayev D., Atavliyeva S. ...
  • Mustafa S. I., Schwarzacher T. and Heslop-Harrison J. S. ۲۰۱۸. ...
  • Oner Y., Calvo J. H. and Elmaci C. ۲۰۱۳. Investigation ...
  • Peakall R. and Smouse P. E. ۲۰۱۲. GenAlEx ۶.۵: genetic ...
  • Pedrosa S., Arranz J. J., Brito N., Renseigné N., Primitivo ...
  • Pedrosa S., Uzun M., Arranz J. J., Gutiérrez-Gil B., San ...
  • Rafia P. and Tarang A. ۲۰۱۶. Sequence variations of mitochondrial ...
  • Rozas J., Ferrer-Mata A., Sánchez-DelBarrio J. C., Guirao-Rico S., Librado ...
  • Schroeder O., Benecke N., Frölich K., Peng Z., Kaniuth K., ...
  • Sharma R., Ahlawat S., Sharma H., Sharma P., Panchal P., ...
  • Tapio M., Marzanov N., Ozerov M., Cinkulov M., Gonzarenko G., ...
  • Tarlykov P., Atavliyeva S., Auganova D., Akhmetollayev I., Loshakova T., ...
  • Yeh F. C., Yang R. and Boyle T. ۱۹۹۹. POPGENE. ...
  • نمایش کامل مراجع