مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند

سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 234

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARGU-11-3_002

تاریخ نمایه سازی: 17 بهمن 1401

چکیده مقاله:

چندقلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در گوسفند با تنوع داخل و بین نژادی است. این مطالعه به منظور شناسایی مکان­های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند با رویکرد مگاآنالیز مطالعه ارتباط ژنومی و با استفاده از داده­های ژنوتیپی و فنوتیپی شش نژاد گوسفند از پایگاه داده انجام شد. کنترل کیفیت با استفاده از نرم افزار Plink و ایمپیوتیشن با روش LD-kNNi انجام شد. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم افزار TASSEL  با در نظر گرفتن خویشاوندی و ساختار جمعیت انجام شد. پس از پایان کنترل کیفیت، تعداد ۳۰۵ حیوان و ۳۵۱۶۱۵ نشانگر SNP با متوسط MAF  برابر با ۳۳/۰ برای ادامه تجزیه مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج مگاآنالیز، یک SNP را روی کروموزوم ۲۱ در سطح ژنوم و ۱۰ SNP در سطح کروموزومی روی کروموزوم های ۱، ۲، ۳، ۱۴، ۱۷ و ۲۲ شناسایی کرد که به­طور معنی­داری با چندقلوزایی در گوسفند در ارتباط بودند. ژن­های OPCML، GULP۱، RBP۴، MMP۲ و LPCAT۲ شناسایی شده در این تحقیق، نقش موثری در باروری و موفقیت آبستنی دارند. نتایج این تحقیق می تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترل­کننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.

نویسندگان

محسن قلی زاده

دانشیار، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

سید مهدی اسماعیلی فرد

دانش آموخته دکتری، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdoli R., Mirhoseini S. Z., Ghavi Hossein-Zadeh N., Zamani P. ...
  • Abdoli R., Mirhosseini S. Z., Ghavi Hossein-Zadeh N., Zamani P., ...
  • Abdollahi-Arpanahi R., Carvalho M. R., Ribeiro E. S. and Peñagaricano ...
  • Begum F., Ghosh D., Tseng G. C. and Feingold E. ...
  • Behforouz A., Dastgheib S. A., Abbasi H., Karimi-Zarchi M., Javaheri ...
  • Bernal Rubio Y. L., Gualdron Duart J. L. E., Bates ...
  • Bouwman A. C., Daetwyler H. D., Chamberlain A. J., Ponce ...
  • Bradbury P. J., Zhang Z., Kroon D. E., Casstevens T. ...
  • Cohen M., Meisser A. and Bischof P. ۲۰۰۶. Metalloproteinases and ...
  • Daetwyler H. D., Villanueva B. and Woolliams J. A. ۲۰۰۸. ...
  • Deady L. D., Shen W., Mosure S. A., Spradling A. ...
  • Esmaeili fard S. M., Hafezian S., Gholizadeh M., Abdolahi Arpanahi ...
  • Esmaeili-Fard S. M., Gholizadeh M., Hafezian S. H. and Abdollahi-Arpanahi ...
  • Fleming J. S., McQuillan H. J., Millier M. J. and ...
  • Fritsche L. G., Igl W., Bailey J. N., Grassmann F., ...
  • Gholizadeh M. and Esmaeili-Fard S. M. ۲۰۲۲. Meta-analysis of genome-wide ...
  • Gorski M., Günther F., Winkler T. W., Weber B. and ...
  • Gudjonsson A., Gudmundsdottir V., Axelsson G. T., Gudmundsson E. F., ...
  • Hayes B. and Goddard M. ۲۰۱۰. Genome-wide association and genomic ...
  • Hendrix N. D., Wu R., Kuick R., Schwartz D. R., ...
  • Lin D. Y. and Zeng D. ۲۰۱۰. Meta-analysis of genome-wide ...
  • Ma C. I. J., Martin C., Ma Z., Hafiane A., ...
  • Marjanovic J. and Calus M. P. L. ۲۰۲۰. Factors affecting ...
  • Massague J. ۱۹۹۸. TGF-β signal transduction. Annual Review of Biochemistry, ...
  • Messer L. A., Wang L., Yelich J., Pomp D., Geisert ...
  • Meuwissen T. H. E., Hayes B. J. and Goddard M. ...
  • Money D., Gardner K., Migicovsky Z., Schwaninger H., Zhong G. ...
  • Pasandideh M., Rahimi-Mianji G., Gholizadeh M. and Fontanesi L. ۲۰۱۷. ...
  • Purcell S., Neale B., Todd-Brown K., Thomas L., Ferreira M. ...
  • Schwartz D. R., Wu R., Kardia S. L., Levin A. ...
  • Sellar G. C., Watt K. P., Rabiasz G. J., Stronach ...
  • Sung Y. J., Schwander K., Arnett D. K., Kardia S. ...
  • Taghizade K., Gholizadeh M., Moradi M. and Rahimi Mianji G. ...
  • Tenghe A. M. M., Bouwman A. C., Berglund B., Strandberg ...
  • Tsou J. A., Galler J. S., Siegmund K. D., Laird ...
  • VanRaden P. M., van Tassell C. P., Wiggans G. R., ...
  • Xu S. S., Gao L., Xie X. L., Ren Y. ...
  • Yelich J. V., Pomp D. and Geisert R. D. ۱۹۹۷. ...
  • نمایش کامل مراجع