استفاده از روش های سری زمانی جهت پیش بینی بیان ژن های دفاعی گندم تلقیح شده با Zymoseptoria tritici و اسیدسالیسیلیک
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 122
فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARPP-8-4_006
تاریخ نمایه سازی: 24 بهمن 1401
چکیده مقاله:
چکیده اندازهگیری میزان بیان ژنهای دفاعی گیاهی روشی پرکاربرد و مفید برای بررسی مکانیسم مقاومت در گیاهان است، اما این روش در عین حال هزینه بر و زمانبر نیز میباشد. به منظور بررسی تاثیر اسیدسالیسیلیک بر تغییرات بیان بعضی از ژنهای دفاعی درگیر در مقاومت (NADPH اکسیداز، اگزالات اکسیداز، پروتئین Stress responsive، گلوتاتیون S ترانسفراز و سوپراکسید دیسموتاز) گندمهای تلقیح شده با بیمارگر Z. triticiبه روش نوردرنبلات معکوس بررسی شد. بر اساس اطلاعات به دست آمده از نوردرن بلات معکوس جهت پیشبینی بیان ژنهای درگیر در مقاومت از روشهای میانگین متحرک ساده، میانگین متحرک وزنی و هموار سازی نمایی استفاده شد. در ۲۴ ساعت بعد از تلقیح بیمارگر در همه ژنهای مورد بررسی و در هر دو تیمار میزان بیان به بیشترین مقدار خود رسید و علیرغم تفاوت در هر ژن روند کلی افزایشی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از روش هموارسازی نمایی، با توجه به محاسبه و مقایسه شاخصهای قدرت پیشبینی، دارای دقت بالاتری نسبت به دو روش دیگر میباشد. میزان بیان، در مورد سه ژن NADPH اکسیداز، گلوتاتیون S ترانسفراز و اگزالات اکسیداز روند مشابه داشتند، به عبارتی تا ۲۴ ساعت بعد از تلقیح بیمارگر، اسیدسالیسیلیک باعث افزایش شد و سپس میزان بیان روند کاهشی در پیش گرفت. بررسی بیان ژن روش بسیار حساسی است، و باید تحت شرایط کنترل شده باشد، و فقط تیمار مورد نظر محقق، تاثیرگذار بر روی بیان ژن در گیاه باشد، در این شرایط، پیشنهاد میشود اطلاعات بیان ژنها در طی دورههایی ابتدایی اندازهگیری شود، سپس با استفاده از این اطلاعات و روشهای پیشبینی میزان بیان، برای زمانهای بعدی مورد پیشبینی قرار گیرد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
جلال غلام نژاد
استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.
فروغ سنجریان
استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران.
مسعود فهرستی
استادیاردانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اردکان، اردکان، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :