شناسایی ژن های متفاوت بیان شده در جوجه های آلوده به ویروس H۵N۱ با استفاده از فرا تحلیل داده های ریزآرایه DNA
محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 7، شماره: 3
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 131
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-7-3_002
تاریخ نمایه سازی: 27 بهمن 1401
چکیده مقاله:
پیدا کردن نیم رخ بیان ژنی در طول سالهای اخیر، منجر به شناسایی ژنهای خاص در پاسخ به بیماریهای گوناگون شدهاست. یکی از این بیماریهای مهم در صنعت طیور، بیماری آنفولانزا است. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی ژنهای موثر در بروز آنفولانزای ناشی از ویروس H۵N۱ با استفاده از فراتحلیل دو مجموعه داده ریزآرایه DNA که بیان ژنهای میزبان در پاسخ به آنفولانزا را مورد بررسی قرار داده بودند، بود. فراتحلیل نشان داد که ژنهای STK۱۷B، CCL۴، MCM۹، IRF۷ و IL۶ با روشهای Fisher، AW و maxP متمایز بیان می شوند. برای تایید تمایز بیان ژنهای شناسایی شده در آزمایشگاه از Real-time PCR استفاده شد. بدین منظور از نمونههایی استفاده شد که پیشتر با ویروس H۵N۱ چالش داده شده بودند. نتایج برای هر پنج ژن انتخابی، تمایز بیان آنها را در حالت مواجهه با آلودگی و حتی جهت تنظیمی بیان را که در فراتحلیل مشاهده شده بود، در سطوح معنیدار تایید نمود، به گونهای که ژنهای IL۶، IRF۷ و CCL۴ افزایش بیان و ژنهای STK۱۷B و MCM۹ کاهش بیان نشان دادند. این نتایج پیشنهاد میدهند فراتحلیل روشی بسیار قوی در شناسایی ژنهایی است که ممکن است در پژوهشهای انفرادی مورد توجه قرار نگیرند. این ژنها ممکن است نقش حیاتی در تنظیم پاسخ میزبان ایفا نمایند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مونا صالحی نسب
دانشجوی دکتری دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قدرت الله رحیمی میانجی
استاد دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
اسماعیل ابراهیمی
دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز
سید علی غفوری
استادیار سازمان دامپزشکی ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :