ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

چندشکلی و بیان دو پروتئین LysM-RLK در سیب زمینی قبل و بعد از بروز بیماری بلایت زودرس

محل انتشار: پژوهش های کاربردی در گیاه پزشکی، دوره: 8، شماره: 2
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 136

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1615933

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-8-2_003

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

چکیده گیرنده­های (LysM-RLKs) Lysin Motif Receptor-like Kinases، به­ دلیل وجود موتیف لیزین ((LysM، به کیتین آزاد شده از دیواره­ی قارچ­ها متصل و سبب فعال شدن آبشاری از پروتئین­ها و در نهایت سبب افزایش مقاومت به پاتوژن­ها می­شوند. برای بررسی بیان LysM-RLKs احتمالی ژنوم سیب زمینی در یک رقم حساس (Russet Burbank) و یک ژنوتیپ نسبتا مقاوم (F۰۶۰۳۷) به Alternaria solani، میزان بیان و توالی LysM آنها به روش­های بیوانفورماتیکی و مولکولی مطالعه شد. در مجموع ۳۵ پروتئین LysM-RLKs در ژنوم سیب زمینی شناسایی شد که از این تعداد، ۲۶ پروتئین بدون LysM و تعداد پنج وچهار پروتئین به ترتیب دارای یک یا دو LysM بودند. از نه گیرنده LysM-RLKs ، تعداد دو گیرنده LysM-RLKs در اثر آلودگی­ به A. solani افزایش بیان نشان دادند. پروتئین PGSC۰۰۰۳DMP۴۰۰۰۶۱۳۳۱ با دو LysM بیان بیشتری در مقایسه با پروتئین PGSC۰۰۰۳DMP۴۰۰۰۶۰۴۱۸ با یک LysM داشت. این پروتئین­ها به ترتیب با پروتئین CERK۱ آرابیدوپسیس (AB۳۶۷۵۲۴) ۹۸ و ۸۱ درصد شباهت داشتند. همردیفی ناحیه­ی LysM این دو پروتئین با یکدیگر و با ناحیه­ی همولوگ در پروتئین CERK۱ آرابیدوپسیس نشان داد که دو LysM پروتئین PGSC۰۰۰۳DMP۴۰۰۰۶۱۳۳۱ در دو رقم تفاوتی نداشتند، اما در LysM اول پروتئین PGSC۰۰۰۳DMP۴۰۰۰۶۱۳۳۱ یک ناحیه به توالی "NRD" وجود دارد که در LysM دوم همین پروتئین و پروتئین CERK۱ آرابیدوپسیس دیده نمی­شود و به نظر می­رسد که حاصل حذف یا اضافه شدگی باشد. با انجام روش­های ویرایش ژنوم می­توان نقش این ژن­ها را در موضوع مقاومت یا حساسیت به قارچ A. solaniمشخص نمود و از نتایج حاصل برای تولید گیاهان تراریخت مقاوم استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فرهاد نظریان فیروزآبادی

استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد.

کوشالاپا آجامادا

استاد، دانشکده علوم گیاهی، دانشگاه مک گیل، سنت ان د بلوو، کانادا.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aalen RB, ۲۰۱۷. Plant Receptor Kinases:Methods and Protocols, Ed, Vol(۱۶۲۱), ...
  • Arrighi J-F, Barre A, Amor BB, Bersoult A, Soriano LC, ...
  • Bagherabadi S, Zafari D, Soleimani MJ, ۲۰۱۵. A report on ...
  • Beliveau C, Potvin C, Trudel J, Asselin A, Bellemare G, ...
  • Bolton MD, van Esse HP, Vossen JH, de Jonge R, ...
  • Buist G, Steen A, Kok J, Kuipers OP, ۲۰۰۸. LysM, ...
  • Carotenuto G, Chabaud M, Miyata K, Capozzi M, Takeda N, ...
  • Chenna R, Sugawara H, Koike T, Lopez R, Gibson TJ, ...
  • Conrath U, Linke C, Jeblick W, Geigenberger P, Quick WP, ...
  • Corpet F, ۱۹۸۸. Multiple sequence alignment with hierarchical clustering. Nucleic ...
  • Couto D, Zipfel C, ۲۰۱۶. Regulation of pattern recognition receptor ...
  • De Jonge R, Thomma BP, ۲۰۰۹. Fungal LysM effectors: extinguishers ...
  • Erwig J, Ghareeb H, Kopischke M, Hacke R, Matei A, ...
  • Espinoza C, Liang Y, Stacey G, ۲۰۱۷. Chitin receptor CERK۱ ...
  • Garvey KJ, Saedi MS, Ito J, ۱۹۸۶. Nucleotide sequence of ...
  • Hall TA (۱۹۹۹) BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Jones JD, Dangl JL, ۲۰۰۶. The plant immune system. Nature ...
  • Letunic I, Doerks T, Bork P, ۲۰۱۴. SMART: recent updates, ...
  • Lin W, Lu D, Gao X, Jiang S, Ma X, ...
  • Liu Z, Wu Y, Yang F, Zhang Y, Chen S, ...
  • Livak KJ, Schmittgen TD, ۲۰۰۱. Analysis of relative gene expression ...
  • Macho AP, Zipfel C, ۲۰۱۴. Plant PRRs and the activation ...
  • Madsen EB, Madsen LH, Radutoiu S, Olbryt M, Rakwalska M, ...
  • Marchler-Bauer A, Bo Y, Han L, He J, Lanczycki CJ, ...
  • Mélida H, Sopeña‐Torres S, Bacete L, Garrido‐Arandia M, Jordá L, ...
  • Miya A, Albert P, Shinya T, Desaki Y, Ichimura K, ...
  • Narusaka Y, Shinya T, Narusaka M, Motoyama N, Shimada H, ...
  • Nicot N, Hausman J-F, Hoffmann L, Evers D, ۲۰۰۵. Housekeeping ...
  • Pasche J, Piche L, Gudmestad N, ۲۰۰۵. Effect of the ...
  • Petutschnig EK, Jones AM, Serazetdinova L, Lipka U, Lipka V, ...
  • Petutschnig EK, Stolze M, Lipka U, Kopischke M, Horlacher J, ...
  • Radutoiu S, Madsen LH, Madsen EB, Felle HH, Umehara Y, ...
  • Ray PD, Huang B-W, Tsuji Y, ۲۰۱۲. Reactive oxygen species ...
  • Schultz J, Copley RR, Doerks T, Ponting CP, Bork P, ...
  • Shimizu T, Nakano T, Takamizawa D, Desaki Y, Ishii-Minami N, ...
  • Shinya T, Yamaguchi K, Desaki Y, Yamada K, Narisawa T, ...
  • Shiu S-H, Bleecker AB, ۲۰۰۱a. Plant receptor-like kinase gene family: ...
  • Shiu S-H, Bleecker AB, ۲۰۰۱b. Receptor-like kinases from Arabidopsis form ...
  • Shiu S-H, Bleecker AB, ۲۰۰۳. Expansion of the receptor-like kinase/Pelle ...
  • Sigrist CJ, De Castro E, Cerutti L, Cuche BA, Hulo ...
  • Tanaka K, Nguyen CT, Liang Y, Cao Y, Stacey G, ...
  • Torii KU, ۲۰۰۹. Transmembrane receptors in plants: receptor kinases and ...
  • Tsedaley B, ۲۰۱۴. Review on early blight (Alternaria spp.) of ...
  • Van der Waals JE, Korsten L, Slippers B, ۲۰۰۴. Genetic ...
  • Wang C, Wang G, Zhang C, Zhu P, Dai H, ...
  • Zhou X, Wang J, Peng C, Zhu X, Yin J, ...
  • Zipfel C, ۲۰۰۸. Pattern-recognition receptors in plant innate immunity. Current ...
    • نمایش کامل مراجع