شناسایی مولکولی سه گونه ویروس در مزارع گوجه فرنگی استان آذربایجان شرقی

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 136

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-6-4_003

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

چکیده مقاله:

چکیده آلودگی به ویروس های شایع مزارع گوجه­فرنگی شامل Cucumber mosaic virus (CMV)،Tomato spotted wilt virus (TSWV) ،Tomato mosaic virus (ToMV)  و Tobacco mosaic virus (TMV) در آذربایجان­شرقی مورد بررسی قرار گرفت. تعداد ۲۰۵ نمونه دارای علائم موزاییک، کوتولگی، نکروز، باریک شدن، بدشکلی برگ­ها و میوه­ها جمع­آوری و از نظر بررسی علائم، مورد مطالعات گلخانه­ای قرار گرفتند. سپس آزمون الایزا برای ردیابی  CMV روی نمونه­های مشکوک به آلودگی با این ویروس انجام پذیرفت. پس از استخراج RNA کل از نمونه­های آلوده، RT-PCR با آغازگرهای اختصاصی CMV، آغازگرهای عمومی جنس توسپوویروس یا توباموویروس با توجه به علایم ویروسی انجام شد. با بهینه سازی PCR از نظر دمای اتصال، قطعات تکثیر یافته­ی مورد انتظار در تعداد ۶، ۳۷ و ۲۳ نمونه به ترتیب با آغازگرهای توسپوویروس، توباموویروس یا CMV حاصل شد. پروفیل برش آنزیمی با HindIII ، EcoRI و XbaI روی قطعات تکثیر یافته با آغازگرهای توسپوویروس از تعداد شش نمونه نشان داد که هویت ویروس در همه­ی آنها TSWV بود. همسانه سازی و تعیین توالی این قطعات نیز ماهیت TSWV بودن جدایه­ها را تایید نمود. قطعات DNA تکثیر یافته با آغازگرهای توباموویروس با TaqI برش داده شدند که طبق پروفیل برشی، آلودگی ­ به ToMV در ۳۷ نمونه محرز شد در حالی که TMV در هیچیک از نمونه ها پیدا نشد. برش محصول PCR حاصل از آغازگرهای CMV با آنزیم MspI هم نشان داد که جدایه­های CMV متعلق به زیر گروه I این ویروس بودند. همچنین، نتایج گویای فراوانی بیشتر آلودگی با CMV و ToMV در نمونه­ ها بود.

کلیدواژه ها:

واژه های کلیدی: ویروس پژمردگی لکه ای گوجه فرنگی ، ویروس موزاییک خیار ، ویروس موزاییک گوجه فرنگی ، ویروس موزاییک توتون

نویسندگان

داود کولیوند

استادیار بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان.

نعمت سخندان بشیر

دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز.

شهین صبحی

دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز.

مینا راستگو

استادیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه ارومیه.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • بی نام، ۱۳۹۴. آمار نامه کشاورزی ایران. اداره کل آمار ...
  • Alonso E, Garcia- Luque I, Avila- Rincon MJ, Wicke B, ...
  • Bananej K, Ahoonmanesh A, Shahraeen N and Lesemann D, ۱۹۹۶. ...
  • Chiemsombat P, Gajanandana O, Warin N, Hongprayoon R, Bhunchoth A, ...
  • Chitra TR, Prakash, HS, Albrechtsen SE, Shetty HS, and. Mathur ...
  • Crowther J.R. (ed.). ۲۰۰۹. The ELISA Guidebook. ۲nd edition, Springer ...
  • Gallitelli D, ۲۰۰۰. The ecology of cucumber mosaic virus and ...
  • Ghotbi T, Shahraeen N and Winter S, ۲۰۰۵. Occurrence of ...
  • Golnaraghi A, Shahraeen N, Pourrahim R, Ghorban S and Farzadfar ...
  • Hajiabadi AM, Asaei F, Abdollahi MB and Rastgou M, ۲۰۱۲. ...
  • Hajiabadi AM, Jafarpour B, Rastegar MF and Mandoulakani BA, ۲۰۰۹. ...
  • Hassani-Mehraban A, Botermans M, Verhoeven JTJ, Meekes E, Saaijer J, ...
  • Hollings M, Huttinga H, ۱۹۷۶. Tomato mosaic virus. Description of ...
  • Jones DR, ۲۰۰۵. Plant viruses transmitted by thrips. European Journal ...
  • Kaye A, Moyer J, Parks E, Carbone I and Cubeta ...
  • King A MQ., Andams MJ, Carstens EB, and Lefkowitz EJ, ...
  • Letschert B, Adam G, Lesemann DE, Willingmann P and Heinze ...
  • Massumi H, Shaabanian M, Hosseinipour A, Heydarnejad J and Rahimian ...
  • Mohammadi M, Esmaeeli-far A, Zad J, Mossahebi G, and Okhovat ...
  • Nischwitz C, Mullis S W, Gitaitis R D, and Csinos ...
  • Palukaitis P, Roossinck MJ, Dietzgen RG and Francki RIB, ۱۹۹۲. ...
  • Pappu HR, Toit LJ, Schwartz HF, and Mohan SK, ۲۰۰۶. ...
  • Pourrahim R, Farzadfar S, Moini A, Shahraeen N and Ahoonmanesh ...
  • Rizos H, Gunn LV, Pares RD and Gillings RM, ۱۹۹۲. ...
  • Rowhani A, Chay C, Golino DA and Falk W, ۱۹۹۳. ...
  • Sokhandan bashir N, Nematollahi S and Torabi E, ۲۰۰۸. Cucumber ...
  • Sokhandan Bashir N, Rasaei Kalhor M and Nourinejhad Zarghani S, ...
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A and Kuma ...
  • Tsompana M, Abad J, Purugganan M and Moyer J, ۲۰۰۵. ...
  • Vinayarani G, Madhusudhan KN, Deepak SA, Niranjana SR and Prakash ...
  • Whitfield AE., Ullman DE and German TL, ۲۰۰۵. Tospovirus-thrips interactions. ...
  • Zaitlin M, ۲۰۰۰. Tobacco mosaic virus. Description of plant viruses. ...
  • نمایش کامل مراجع