اولویت بندی و شناسایی ژن های کاندید در برخی صفات ریشه گندم نان (Triticum aestivum L.) تحت تنش شوری
محل انتشار: مجله پژوهش های ژنتیک گیاهی، دوره: 9، شماره: 1
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 148
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PGRLU-9-1_006
تاریخ نمایه سازی: 29 فروردین 1402
چکیده مقاله:
تنش شوری یکی از مهم ترین عوامل محدودکننده محیطی در تولید انواع محصولات کشاورزی از جمله گندم است، به طوری که تولید ارقام جدید متحمل به شوری می تواند یکی از راه کارهای موثر در کاهش اثرات تنش در نظر گرفته شود. در این راستا، شناسایی ژن های موثر و مکانیسم های مولکولی درگیر در ایجاد تحمل شوری گامی مهم برای برنامه های بهنژادی به شمار می رود. در مطالعه حاضر، یک جمعیت از لاین های اینبرد نوترکیب (RIL) F۱۲ شامل ۱۸۶ ژنوتیپ برای شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده برخی ویژگی های فیزیولوژی و میزان عناصر در مرحله گیاهچه ای گندم در شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع دوازده QTL اصلی با استفاده از آنالیز مکان یابی فاصله ای مرکب (CIM) برای وزن تر، وزن خشک، طول، میزان سدیم و پتاسیم ریشه شناسایی شدند. بیشترین تعداد QTLهای شناسایی شده بر روی کروموزوم های B وD قرار داشتند. تجزیه هستی شناسی ژن ها (Gene ontology) انجام و ژن های کاندید در ناحیه QTL شناسایی شدند؛ اگرچه قابل ذکر است که ژن های کاندید (CG)، برای تایید، نیازمند شناسایی به کمک نشانگر هستند. در مجموع اولویت بندی ژن ها منتهی به تعیین ۳۴۸۶ ژن کاندید در ۱۹ عبارت GO (شامل ۸ فرآیند زیستی) شد که در فرآیندهای متابولیسم گلوتاتیون، کاتابولیک ال-فنیل آلانین، ترجمه سیتوپلاسمی، مسیر پیام رسانی فعال شده با اکسین، تنظیم رونویسی، DNA-الگو، پروتوپورفیرینوژن IX، سازمان و پیدایش دیواره سلولی، متابولیسم Xyloglucan، آمینوسیلاسیون لوسیل-tRNA، گلیکوزیلاسیون پروتئین، تنظیم رونویسی، بیوسنتز رنگ دانه و غیره نقش دارند. این روش (Gene ontology) ممکن است برای شناسایی CG های جدید ارائه شود که QTL مربوطه، مسئول صفات پیچیده است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
الینا نظری خاکشور
Department of Plant Breeding, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran
امین آزادی
Department of Plant Breeding, Yadegar-e-Imam Khomeini (RAH) Shahre Rey Branch, Islamic Azad University, Shahre Rey, Iran
پیمان فروزش
Department of Plant Breeding, Karaj Branch, Islamic Azad University, Karaj, Iran
علیرضا اطمینان
Department of Biotechnology and Plant Breeding, Kermanshah Branch, Islamic Azad University, Kermanshah, Iran
اسلام مجیدی هروان
Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :