بررسی تنوع ژنتیکی فوزاریوم های بخش Elegans و Martiella-Ventricosum مرتبط با کدوییان با استفاده از نشانگرهای ISSR در استان تهران
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 15، شماره: 1
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 94
فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-15-1_007
تاریخ نمایه سازی: 2 خرداد 1402
چکیده مقاله:
هدف: هدف از این تحقیق شناسایی فوزاریوم های بخش های Elegans و Martiella-Ventricosum مرتبط با گیاهان تیره کدوئیان در استان تهران و ارزیابی توانایی نشانگرهای ISSR در بررسی روابط خویشاوندی این گروه از فوزاریوم ها بود. مواد و روش ها: در این پژوهش تعداد پنج آغازگر (ATG)۶، (AC)۸YA، (AG)۸G، (AG)۸C و BHB(GA)۷ که بر اساس مطالعات محققین مختلف، در تمایز نژادهای مختلف فوزاریوم، کارایی خوبی از خود نشان داده بودند، جهت انجام این آزمایش ها انتخاب شد. جدایه های قارچی پس از جداسازی و خالص سازی بر اساس خصوصیات ریخت شناسی و میکروسکوپی مورد شناسایی قرار گرفتند. جهت بررسی میزان کارایی نشانگرها در بروز چندشکلی، آماره های محتوای اطلاعات چندشکلی آغازگرها Polymorphism Information Content (PIC)، شاخص نشانگری Marker Index (MI) و نسبت چندگانه موثرEffective Multiplex Ratio (EMR) محاسبه شد. روابط داخل گونه های Fusarium با استفاده از نرم افزار NTSYS-PC V۲.۰۲ و ضریب تشابه SM و ترسیم دندوگرام به روش UPGMA مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج: از مجموع ۹۶ جدایه قارچی، تعداد ۴۸ جدایه به عنوان Fusarium solani، تعداد ۲۵ جدایه به عنوان Fusarium oxysporum و تعداد ۲۳ جدایه به عنوان Fusarium redolens تشخیص داده شدند. تمامی پنج آغازگر ISSR در طول آزمایشات PCR، باندهایی پایدار و قابل تکرار تولید کردند. از تکثیرهای ISSR مجموعا ۴۰۸ باند به دست آمد. تعداد ۱۳۰ نوع باند متفاوت تولید شد که از این تعداد، ۸۳ باند پلی مورفیک و ۴۷ باند مونومورفیک بود. . اندازه ی قطعات PCR تولید شده از ۲۷۳ تا ۲۴۲۸ جفت باز متغیر بود. درصد چندشکلی به دست آمده از بیشترین (۷۳ درصد) برای UBC-۸۶۴ تا کمترین (۵۶ درصد) برای UBC-۸۰۸ متغیر بود. آغازگرهای (ATG)۶ و BHB(GA)۷ در تفکیک بخش های Elegans و Martiella-Ventricosum از همدیگر عملکرد بهتری داشتند. آغازگر UBC-۸۰۸ ((AG)۸C) با تولید ۲۶ جایگاه ژنی بیشترین تولید باند را در جدایه های بخش Elegans و آغازگر UBC-۸۸۵ (BHB(GA)۷) با تولید ۲۵ باند بیشترین تولید باند را در مورد جدایه های بخش Martiella-Ventricosum داشت. نتیجه گیری: نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگر ISSR یک نشانگر کارآمد جهت آشکارسازی روابط مولکولی بین توده ها و جدایه های قارچ فوزاریوم می باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
فرودعلی خزایی
دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه لرستان، خرمآباد، ایران
مصطفی درویش نیا
گروه گیاهپزشکی،دانشکده کشاورزی،دانشگاه لرستان،خرم آباد،ایران
عیدی بازگیر
گروه گیاهپزشکی،دانشکده کشاورزی،دانشگاه لرستان،خرم آباد،ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :