بررسی بیوانفورماتیکی دفنسین ها جهت شناسایی مناسب ترین مولکول فعال زیستی

گیاهان حاوی پروتئین های فعال غنی از سیستئین در برابر پاتوژنها می باشند. دفنسین های گیاهی خانواده ای از پپتیدهای کاتیونی و دفاعی گیاهان هستند که در ریشه ها، دانه ها، برگها و اندامهای گل یافت می شوند. دفنسین ها با ایجاد اختلال در غشای سلولی طیف وسیعی از میکروارگانیسم ها منجر به مرگ آنها می شوند. به منظور شناسایی و تولید بهترین دفنسین در مهندسی ژنتیک باید محصول ژن کدکننده دفنسین ها از نظر پارامترهای مختلف فیزیکوشیمیایی ، ساختاری و تکاملی بررسی شود. براساس نتایج روابط تکاملی ، دفنسین های گیاهان به دوگروه اصلی تقسیم می شوند. بیشترین پایداری مربوط به دفنسین Picea asperata از کلاستر اول می باشد. گیاه Pinus sylvestris بیشترین شباهت و کمترین فاصله را با دفنسین Picea asperata نشان داد. به دلیل تفاوت ویژگی های ذکر شده دفنسین در گونه های مختلف گیاهی ، باید ابتدا قبل از شروع کلونینگ و بیان، مناسب ترین گیاه و دفنسین را بر اساس پارامترهای ذکرشده انتخاب و بررسی شوند.