Fundamentals, applications, and challenges of the ۳K rice genomes project

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 111

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJGPB-10-2_005

تاریخ نمایه سازی: 28 خرداد 1402

چکیده مقاله:

For more than half of the world’s population, rice (Oryza sativa L.) is the primary source of nutrition. Rice production must expand by at least ۲۵ percent by ۲۰۳۰ to feed the world’s ever-increasing population. As climate change and arable land loss take a tremendous toll on the world’s food supply, genetic advancements in rice would be crucial for alleviating the yield gap. We must first obtain extensive information on the genetic diversity of the Oryza spp. gene pool, the association between diverse alleles and critical rice characteristics, and the systematic exploitation of the rich genetic diversity using approaches that employ expertise in rice breeding procedures. The vast genetic diversity of rice cannot be represented by a single genome. To produce variants that are more tolerant to adverse weather conditions, a multi-national rice genome sequencing project was launched on May ۲۸, ۲۰۱۴. Genes associated with drought tolerance, disease resistance, and pest resistance in rice could be identified using the above mentioned genetic information. Using diverse germplasm resources and high-throughput genome sequencing projects, rice genomics has made great progress toward applying basic research advances to understanding agronomic traits. It is important to remember that many important genes are missing from the previous sequencing projects, and many useful genes are present in native and traditional populations that cannot be retrieved without gene sequencing.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مجتبی کردرستمی

Nuclear Science and Technology Research Institute (NSTRI), Nuclear Agriculture Research School, Karaj, Iran.

علی اکبر قاسمی سلوکلوئی

Nuclear Science and Technology Research Institute (NSTRI), Nuclear Agriculture Research School, Karaj, Iran.

مهدی رحیمی

Department of Biotechnology, Institute of Science and High Technology and Environmental Sciences, Graduate University of Advanced Technology, Kerman, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • ۳۰۰۰ Rice Genomes Project. (۲۰۱۴). The ۳,۰۰۰ rice genomes project. ...
  • Adlak T., Tiwari S., Tripathi M., Gupta N., Sahu V. ...
  • Ahmar S., Gill R. A., Jung K.-H., Faheem A., Qasim ...
  • Anilkumar C., Sah R. P., Muhammed A. T., Sunitha N., ...
  • Anwar K., Joshi R., Morales A., Das G., Yin X., ...
  • Bommisetty R., Chakravartty N., Bodanapu R., Naik J. B., Panda ...
  • Edzesi W. M., Dang X., Liang L., Liu E., Zaid ...
  • Escaramís G., Docampo E., and Rabionet R. (۲۰۱۵). A decade ...
  • Francia E., Pecchioni N., Policriti A., and Scalabrin S. (۲۰۱۵). ...
  • Fuentes R. R., Chebotarov D., Duitama J., Smith S., De ...
  • Futschik A., and Schlötterer C. (۲۰۱۰). The next generation of ...
  • Gouda G., Gupta M. K., Donde R., Kumar J., Parida ...
  • Gu H., Liang S., and Zhao J. (۲۰۲۲). Novel sequencing ...
  • Gupta M. K., Gouda G., Donde R., Selvaraj S., Dash ...
  • Gutaker R. M., Groen S. C., Bellis E. S., Choi ...
  • Hasan N., Choudhary S., Naaz N., Sharma N., and Laskar ...
  • Islam S. M. F., and Karim Z. (۲۰۱۹). World’s demand ...
  • Jia L., Xie L., Lao S., Zhu Q.-H., and Fan ...
  • Junliang Z. V., and Dilin L. (۲۰۲۲). Rice genetics, genomics ...
  • Katara J. L., Parameswaran C., Devanna B., Verma R. L., ...
  • Kaur B., Sandhu K. S., Kamal R., Kaur K., Singh ...
  • Kebriyaee D., Kordrostami M., Rezadoost M. H., and Lahiji H. ...
  • Konishi S., Izawa T., Lin S. Y., Ebana K., Fukuta ...
  • Kordrostami M., and Mafakheri M. (۲۰۲۱). Consequences of Water Stress ...
  • Kordrostami M., Mafakheri M., and Chaleshtori M. H. (۲۰۲۱). Characteristics ...
  • Kordrostami M., and Rabiei B. (۲۰۱۹). Major databases to study ...
  • Kordrostami M., Rabiei B., and Kumleh H. H. (۲۰۱۷). Different ...
  • Kordrostami M., and Rahimi M. (۲۰۱۵). Molecular markers in plants: ...
  • Kumar J., Pratap A., and Kumar S. (۲۰۱۵). Plant phenomics: ...
  • Kumar P., Choudhary M., Jat B., Kumar B., Singh V., ...
  • Kumawat S., Raturi G., Dhiman P., Sudhakarn S., Rajora N., ...
  • Lenaerts B., Collard B. C., and Demont M. (۲۰۱۹). Improving ...
  • Li J.-Y., Wang J., and Zeigler R. S. (۲۰۱۴). The ...
  • Li Z.-K., and Zhang F. (۲۰۱۳). Rice breeding in the ...
  • Lu J., Wang C., Zeng D., Li J., Shi X., ...
  • Mafakheri M., and Kordrostami M. (۲۰۲۰). Role of Molecular Tools ...
  • McCouch S. R., McNally K. L., Wang W., and Sackville ...
  • McNally K. L., Jackson M., Ford-Lloy B., and Parry M. ...
  • Mills R. E., Walter K., Stewart C., Handsaker R. E., ...
  • Mullaney J. M., Mills R. E., Pittard W. S., and ...
  • Nie L., and Peng S. (۲۰۱۷). Rice production in China. ...
  • Olsen K. M. (۲۰۲۲). The rice pangenome branches out. Cell ...
  • Palanisami K., Kakumanu K. R., Nagothu U. S., and Ranganathan ...
  • Paul A. (۲۰۲۰). Sequencing the rice genome: gateway to agricultural ...
  • Pervez M. T., Abbas S. H., Moustafa M. F., Aslam ...
  • Purugganan M. D., and Jackson S. A. (۲۰۲۱). Advancing crop ...
  • Rabiei B., Kordrostami M., Sabouri A., and Sabouri H. (۲۰۱۵). ...
  • Ram S. G., Thiruvengadam V., and Vinod K. K. (۲۰۰۷). ...
  • Ramadas V. S. (۲۰۱۸). Consumption pattern of traditional and non-traditional ...
  • Rana N., Rahim M. S., Kaur G., Bansal R., Kumawat ...
  • Rivero R. M., Mittler R., Blumwald E., and Zandalinas S. ...
  • Roitsch T., Cabrera-Bosquet L., Fournier A., Ghamkhar K., Jiménez-Berni J., ...
  • Saad N. S. M., Neik T. X., Thomas W. J., ...
  • Sakhale S., Yadav S., Clark L., Lipka A., Kumar A., ...
  • Salgotra R. K., and Chauhan B. S. (۲۰۲۳). Genetic diversity, ...
  • Seck P. A., Diagne A., Mohanty S., and Wopereis M. ...
  • Shahzad A., Ullah S., Dar A. A., Sardar M. F., ...
  • Song S., Tian D., Zhang Z., Hu S., and Yu ...
  • Sun C., Hu Z., Zheng T., Lu K., Zhao Y., ...
  • Sweeney M. T., Thomson M., Pfeil B. E., and McCouch ...
  • Thangadurai D., Kordrostami M., Islam S., Sangeetha J., Al-Tawaha A. ...
  • Tu Anh T. T., Khanh T. D., Dat T. D., ...
  • Wang B., Kumar V., Olson A., and Ware D. (۲۰۱۹). ...
  • Wang W., Mauleon R., Hu Z., Chebotarov D., Tai S., ...
  • Wang Z. Y., Zheng F. Q., Shen G. Z., Gao ...
  • Wei X., and Huang X. (۲۰۱۹). Origin, taxonomy, and phylogenetics ...
  • Wing R. A., Purugganan M. D., and Zhang Q. (۲۰۱۸). ...
  • Würschum T., Boeven P. H., Langer S. M., Longin C. ...
  • Yu H., Xie W., Li J., Zhou F., and Zhang ...
  • Yu S., Xu W., Vijayakumar C., Ali J., Fu B., ...
  • Żmieńko A., Samelak A., Kozłowski P., and Figlerowicz M. (۲۰۱۴). ...
  • نمایش کامل مراجع