تنوع توالی سیتوکروم-b ژنوم میتوکندی در اسبهای کرد ایران

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 157

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-54-2_004

تاریخ نمایه سازی: 13 تیر 1402

چکیده مقاله:

بررسی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم-b ژنوم میتوکندری در درون جمعیت ها می تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد مطالعه باشد. تحقیق اخیر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در اسب کرد و رابطه فیلوژنتیکی اسب کرد با سایر نژادهای اسب در دنیا با استفاده از ناحیه سیتوکروم-b انجام شد. بدین منظور از ۳۰ راس اسب نژاد کرد خون گیری بعمل آمد و DNA آن به روش نمکی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه سیتوکروم-b به طول ۱۰۲۹جفت باز تکثیر و تمام نمونه ها بعد از خالص سازی توالی یابی شدند. قطعه مورد نظر پس از توالی یابی، با نرم افزار BioEdit  ویرایش و قطعه ۸۸۲ جفت بازی از آن استخراج شد. نمونه ها با توالی مرجع اسب به شماره دسترسی (X۷۹۵۴۷) با استفاده از رویه Clustal-W همردیف شدند. تعداد هاپلوتیپ، جایگاههای نوکلئوتیدی متغیر، تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار DNASP۴.۰ تعیین شد. درخت فیلوژنی با استفاده از نرم افزار MEGA۶.۱ به روش Neighbour-joining ترسیم شد. تعداد ۷ هاپلوتایپ با ۷ جایگاه نوکلئوتیدی متغیر شناسایی شد. هاپلوتایپهای بدست آمده همگی در هاپلوگروه K قرار گرفتند. میزان تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی به ترتیب ۰۰۱/۰±۷۸۴/۰ و ۰۰۱/۰±۰۰۲۱۸/۰ برآورد شد. ترکیب نوکلئوتیدها در توالی شاخص شامل ۲۷/۲۱% نوکلئوتید A، ۷۷/۳۲% نوکلئوتید C، ۱۵/۱۳% نوکلئوتید G و ۸۷/۲۶% نوکلئوتید  Tبود. بر اساس نتایج آنالیز فیلوژنی، اسب کرد از نظر ژنتیکی به نژادهایی از ژاپن، چین ، نژادی از لهستان و عربستان نزدیکتر است، که نشان دهنده تشابه ژنتیکی بیشتر اسب کرد با نژادهای آسیایی و تا حدودی اروپایی می باشد..

نویسندگان

حسن جلیلیان مجد

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران.

شیدا ورکوهی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران.

حمیدرضا سیدآبادی

موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Apostolidis, A.P., Alifakiotis, T., Mamuris, Z. & Karkavelia, E. (۲۰۰۰). ...
  • Behroozinia, S., Mirhoseini, S.Z., Afraz, F., Sohrabi, A., Mohammadi, S.A., ...
  • Cieslak, M., Pruvost, M., Benecke, N., Hofreiter, M., Morales, A., ...
  • Devi, K.M. & Ghosh, S.K. (۲۰۱۳). Molecular phylogeny of Indian ...
  • Esposti, M.D., De Vries, S., Crimi, M., Ghelli, A., Patarnello, ...
  • Ibrahimpoor, M.T. & Rezaeinejad, Y. (۲۰۰۵). Horse (۱th ed.). Isfahan ...
  • Jansen, T., Forster, P., Levine, M.A., Oelke, H., Hurles, M., ...
  • Khalili, M. (۲۰۰۸). Horses and my Expertise. (۳th ed.). Zarreh ...
  • Kusza, S., Priskin, K., Ivankovic, A., Jedrzejewska, B., Podgorski, T., ...
  • Lippold, S., Matzke, N.J., Reissmann, M. & Hofreiter, M. (۲۰۱۱). ...
  • Lister, A.M., Kadwell, M., Kaagan, L.M., Jordan, W.C., Richards, M.B. ...
  • Liu, G., Xu, C.Q., Cao, Q., Zimmermann, W., Songer, M., ...
  • Luís, C., Bastos-Silveira, C., Cothran, E. G. & do Mar ...
  • McGahern, A., Bower, M.A.M., Edwards, C.J., Brophy, P.O., Sulimova, J., ...
  • Moridi, M., Masoudi, A.A., Vaez Torshizi, R. & Hill, E.W. ...
  • Qin, F., Wang, X., Zhang, Y., Zhang, M., Li, X. ...
  • Rozas, J., Sánchez-DelBarrio, J.C., Messeguer, X. & Rozas, R. (۲۰۰۳). ...
  • Thompson, J.D., Higgins, D.G. & Gibson, T.J. (۱۹۹۴). CLUSTAL W ...
  • Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, ...
  • Vila, C., Leonard, J.A., Gotherstrom, A., Marklund, S., Sandberg, K., ...
  • Xiao, X., Yang, S., Lin, D., Wang, Y. & Hua, ...
  • Xu, X. & Arnason, U. (۱۹۹۴). The complete mitochondrial DNA ...
  • Yue, X.P., Qin, F., Campana, M.G., Liu, D.H., Mao, C.C., ...
  • نمایش کامل مراجع