تنوع توالی سیتوکروم-b ژنوم میتوکندی در اسبهای کرد ایران
محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 54، شماره: 2
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 157
فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-54-2_004
تاریخ نمایه سازی: 13 تیر 1402
چکیده مقاله:
بررسی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم-b ژنوم میتوکندری در درون جمعیت ها می تواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد مطالعه باشد. تحقیق اخیر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در اسب کرد و رابطه فیلوژنتیکی اسب کرد با سایر نژادهای اسب در دنیا با استفاده از ناحیه سیتوکروم-b انجام شد. بدین منظور از ۳۰ راس اسب نژاد کرد خون گیری بعمل آمد و DNA آن به روش نمکی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه سیتوکروم-b به طول ۱۰۲۹جفت باز تکثیر و تمام نمونه ها بعد از خالص سازی توالی یابی شدند. قطعه مورد نظر پس از توالی یابی، با نرم افزار BioEdit ویرایش و قطعه ۸۸۲ جفت بازی از آن استخراج شد. نمونه ها با توالی مرجع اسب به شماره دسترسی (X۷۹۵۴۷) با استفاده از رویه Clustal-W همردیف شدند. تعداد هاپلوتیپ، جایگاههای نوکلئوتیدی متغیر، تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار DNASP۴.۰ تعیین شد. درخت فیلوژنی با استفاده از نرم افزار MEGA۶.۱ به روش Neighbour-joining ترسیم شد. تعداد ۷ هاپلوتایپ با ۷ جایگاه نوکلئوتیدی متغیر شناسایی شد. هاپلوتایپهای بدست آمده همگی در هاپلوگروه K قرار گرفتند. میزان تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی به ترتیب ۰۰۱/۰±۷۸۴/۰ و ۰۰۱/۰±۰۰۲۱۸/۰ برآورد شد. ترکیب نوکلئوتیدها در توالی شاخص شامل ۲۷/۲۱% نوکلئوتید A، ۷۷/۳۲% نوکلئوتید C، ۱۵/۱۳% نوکلئوتید G و ۸۷/۲۶% نوکلئوتید Tبود. بر اساس نتایج آنالیز فیلوژنی، اسب کرد از نظر ژنتیکی به نژادهایی از ژاپن، چین ، نژادی از لهستان و عربستان نزدیکتر است، که نشان دهنده تشابه ژنتیکی بیشتر اسب کرد با نژادهای آسیایی و تا حدودی اروپایی می باشد..
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسن جلیلیان مجد
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران.
شیدا ورکوهی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران.
حمیدرضا سیدآبادی
موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :