In Silico Prediction of Continuous Epitopes on Human immunoglobulin Light Chains
محل انتشار: مجله علوم پیشرفته زیست پزشکی، دوره: 10، شماره: 3
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 100
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JABS-10-3_006
تاریخ نمایه سازی: 1 مرداد 1402
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: ایمونوگلوبولینها که نقش حیاتی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها دارند, از زنجیره های سبک و سنگین تشکیل شده اند. زنجیره های سبک به دو ایزوتیپ کاپا و لامبدا تقسیم می شوند. تغییرات قابل توجهی در نسبت زنجیره های کاپا به لامبدا در برخی بدخیمی های لنفوسیتهای B روی میدهد. آنتی بادیهای منوکلونال ضد زنجیره های سبک, در تشخیص و ایمونوترا‍پی ناهنجاری های پرولیفراتیو سلولهای B کاربرد دارند. هدف مطالعه حاضر تعیین اپی توپهای پیوسته زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط ایمونوانفورماتیک میباشد.
مواد و روش ها: توالی اسیدهای امینه و ساختار سوم زنجیره سبک ایمونوگلوبولینIgG) G) مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی PDB، ساختار دوم IgG توسط نرم افزار Phyre۲ و اپی توپهای پیوسته زنجیره های سبک توسط نرم افزار های Bepipred و Ellipro تعیین شدند.
نتایج: چهار اپی توپ پیوسته در دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین انسان توسط نرم افزار Bepipred شناسایی شدند . این اپی توپها درناحیه قرارگیری اسیدهای آمینه شماره ۱۱۰-۱۳۰, ۱۵۰-,۱۶۰ ۱۶۰-۱۷۵ و۱۸۰-۲۰۵ واقع شده اند. شاخص ترین اپی توپ در موقعیت اسیدهای آمینه ۱۶۰-۱۷۵ قرار گرفته است. همچنین یک اپی توپ پیوسته در ناحیه اسیدهای آمینه ۱۹۸- ۲۰۳ توسط نرم افزار Ellipro شناسایی شد.
نتیجه گیری: در این پژوهش تعدادی از اپی توپهای پیوسته دومین ثابت زنجیره سبک ایمونوگلوبولین شناسایی شدند. این اپی توپها ابزارهای بسیار ارزشمندی جهت تولید آنتی بادیهای مونوکلونال شناسایی کننده اختصاصی زنجیره سبک ایمونوگلوبولین بوده و میتوانند برای تولید کیتهای تشخیصی اختصاصی زنجیره سبک، کنترل بیماریهای مونوکلونال زنجیرههای سبک, درمان برخی بدخیمی های لنفوسیت B و تعیین نقشه اپی توپهای زنجیره سبک مفید باشند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سهیلا روهانی
Department of Immunology, Faculty of Medicine, Shahed University, Tehran, Iran
فاطمه حاجی قاسمی
Department of Immunology, Faculty of Medicine, Shahed University, Tehran, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :