شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 111

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JASR-15-3_011

تاریخ نمایه سازی: 16 مهر 1402

چکیده مقاله:

پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماری­های مهم مزمن التهاب روده­ای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانه­های انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا می­باشد. به این منظور، مجموع ۳۳۱ حیوان برای ۵۳۳۴۵ جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشه­های Caprine SNP۵۰ BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت داده­های اولیه در نهایت، ۵۱۱۸۲ نشانگر SNP و ۳۲۶ راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتی­بادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (۱۶۲) و بیمار (۱۶۴) گروه­بندی شدند. با در نظر گرفتن صدک ۹/۹۹ کل ارزش­های تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزوم­های ۱، ۵، ۷ (دو منطقه)، ۸، ۹ (دو منطقه)، ۱۱، ۱۶، ۱۷، ۱۸ و ۲۰ (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزوم­های ۳، ۵ (دو منطقه)، ۱۰، ۱۲، ۱۶، ۱۷، ۱۸، ۲۳، ۲۴ و ۲۹ بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژن­های گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژن­های IL۴، IL۱۳، TLR۲، TLR۴، IFNGR۱، PGLYRP۱، CHI۳L۲، PPFIBP۱ و DENND۵B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژن­های موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق می­تواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژن­های مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.

نویسندگان

حسین محمدی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران

محمد شمس اللهی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abbasi Moshaii, B. (۲۰۱۸). Genomic scan for selection signatures and ...
  • Abioja, M. O., Logunleko, M. O., Majekodunmi, B. C., Adekunle, ...
  • Akey, J. M., Zhang, G., Zhang, K., Jin, L., & ...
  • Azizpour, N., Khelatabadi, A., Moradi, M., Mohammadi, H. (۲۰۲۰). Genome-wide ...
  • Chen, Q., Wang, Z., Sun, J., Huang, Y., Hanif, Q., ...
  • Cui, X., Chang, Z., Dang, T., Meng, J., Wang, P., ...
  • Duarte, I. N. H., Bessa, A. F. O., Rola, L. ...
  • Gao, Y., Jiang, J., Yang, S., Cao, J., Han, B., ...
  • Ghoreishifar, S. M., Eriksson, S., Johansson, A. M., Khansefid, M., ...
  • Javan Nikkhah, M. (۲۰۱۹). Identification of selective signatures associated with ...
  • Khaltabadi Farahani, A. H., mohammadi, H., & moradi, H. (۲۰۲۰). ...
  • Kim, H., Song, K. D., Kim, H. J., Park, W., ...
  • Kuenstner, J. T., Naser, S., Chamberlin, W., Borody, T., Graham, ...
  • Kijas, J. W., Lenstra, J. A., Hayes, B., Boitard, S., ...
  • McRae, K. M., McEwan, J. C., Dodds, K. G., & ...
  • Maiorano, A. M., Cardoso, D. F., Carvalheiro, R., Júnior, G. ...
  • Minozzi, G., De Iorio, M. G., Palazzo, F., Gandini, G., ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M. ...
  • Ramey, H., Decker, J., McKay, S., Rolf, M., Schnabel, R., ...
  • Rostamzadeh Mahdabi, E., Esmailizadeh, A., Ayatollahi Mehrgardi, A., & Asadi ...
  • Saravanan, K. A., Panigrahi, M., Kumar, H., Parida, S., Bhushan, ...
  • Sweeney, R. W., Collins, M. T., Koets, A. P., McGuirk, ...
  • Wang, H. L., Li, Z. X., Wang, L. J., He, ...
  • Weir, B. S., & Cockerham, C. C. (۱۹۸۴). Estimating F‐statistics ...
  • Zhu, C., Fan, H., Yuan, Z., Hu, S., Zhang, L., ...
  • نمایش کامل مراجع