بررسی بیوانفورماتیکی برهم کنش پروتئین ملیتین با پروتئین P۲۴ ویروس های HIV و SIV
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 70
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JMUMS-32-214_015
تاریخ نمایه سازی: 1 آبان 1402
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: P۲۴ یکی از اجزای مهم کپسید رتروویروس ها می باشد. مطالعات متعددی اثر مهاری پروتئین ملیتین را بر روی عملکرد ویروس ایدز نشان داده اند. هدف این مطالعه بررسی تاثیر این پروتئین بر روی پروتئین P۲۴ در دو ویروس SIV (ویروس نقص ایمنی میمونی) و HIV (ویروس نقص ایمنی انسانی) با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیکی بود.
مواد و روش ها: توالی های پروتئین P۲۴ دو ویروس SIV و HIV از بانک ژنی دریافت شد و سپس توسط نرم افزارهای متعددی ویژگی های آن بررسی شد. هم چنین تشابهات ساختاری پروتئین P۲۴ در SIV و HIV مورد مطالعه قرار گرفت و از آنالیز داکینیگ برای بررسی برهم کنش پروتئین های ملیتین و P۲۴ استفاده شد و پایداری نتایج داکینیک به روش دینامیک مولکولی تایید شدند.
یافته ها: وجود جایگاه های متعدد فسفوریلاسیون، گلیکوزیلاسیون و پیوند دی سولفید در پروتئین P۲۴ مشاهده شد. نتایج داکینگ نشان دهنده امکان اتصال بالایی بین پروتئین P۲۴ هر دو ویروس و ملیتین بود. هم چنین تشابه بالای ساختار سوم پروتئین P۲۴ در دو ویروس مشخص شد. بررسی دینامیک مولکولی نشان دهنده پایداری مولکولی برهم کنش بین دو پروتئین ملیتین و P۲۴ بود.
استنتاج: انرژی بالای اتصال بین ملیتین و پروتئین P۲۴ نشان دهنده امکان زیاد اتصال این دو پروتئین است که می تواند تعیین کننده اثر مهاری پروتئین ملیتین بر عملکرد ساختار کپسید هر دو ویروس باشد. بررسی تشابه ساختار سوم پروتئین P۲۴ در هر دو ویروس نیز نشان داد علی رغم وجود تفاوت بالا در توالی پروتئینی، آن ها ازلحاظ فولدینگ و ساختار فضایی بسیار مشابه هستند. استفاده از ملیتین در مهار عفونت های SIV در میمون ها می تواند به عنوان مدلی برای مهار ویروس HIV در انسان استفاده شود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا حسن شاهی
MSc in Microbiology, Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
بهزاد دهقانی
BSc in Biology, Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
طیبه هاشم پور
PhD in Virology, Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
جواد مویدی
MSc in Microbiology, Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :