مطالعه بیوانفورماتیکی ژن های منتخب دخیل در مسیر بیوسنتز فلاونوئیدها در زیره سبز

زیره سبز گیاهی یکساله و علفی و متعلق به خانواده جعفری یا چتریان[۱] است .در تحقیق حاضر پنج ژن منتخب موثر در مسیر بیوسنتز فلاونوئیدها که با روش NGS در زیره سبز شناسایی شده و بیشترین تغییر بیانی را داشتند مورد مطالعه بیوانفورماتیکی قرارگرفت. از این میان، دو قطعه ژنی DN۳۲۶۴۰ و DN۱۱۹۶ که دارای بیشترین فاصله تکاملی و از دو خانواده مختلف بودند، جهت شناسایی بیشتر، مورد بررسی قرارگرفتند. توالی DN۱۱۹۶ از خانواده GT۶، یک گلیکوزیل ترانسفراز در مسیر بیوسنتز ترکیبات فنلی، و توالی DN۳۲۶۴۰ از خانواده BHLH، یک فاکتور رونویسی در مسیر بیوسنتز آنتوسیانین می باشد. پروتئین کد شده توالی DN۱۱۹۶، با شباهت بیش از ۸۵ درصدی با پروتئینی از گیاه هویج، در مرحله پایانی سنتز فلاونول، با انتقال یک مولکول گلوکز، آن را گلیکوزیله می کند. در این فرایند دو پروتئین فاکتور رونویسی با این پروتئین در تعامل می باشند. ساختار ثانویه پیش بینی شده محصول این ژن، منطبق با توالی پروتئینی هویج مشخص شد. پروتئین کد شده توالی DN۳۲۶۴۰، با شباهت بیش از ۹۰ درصدی با پروتئین هویج، یک فاکتور رونویسی از خانواده BHLH و جزیی از کمپلکس MBW است. این فاکتور رونویسی در تنظیم مراحل پایانی مسیر منتهی به بیوسنتز آنتوسیانین ها و تانن ها دخالت دارد. ساختار ثانویه محصول این ژن نیز بر اساس توالی پروتئینی شناسایی شده هویج مشخص شد. با توجه به اهمیت این دو ژن و برهمکنش محصول آن ها با سایر پروتئین ها می توان از آن دو در دست ورزی های ژنتیکی جهت تولید بیشتر ترکیبات فنلی خصوصا آنتوسیانین در زیره سبز استفاده نمود.