آنالیز داده های ترانسکریپتوم زعفران در راستای بیان ژن های دخیل در مسیر بیوسنتزی فنیل پروپانویید
محل انتشار: زیست فناوری گیاهان دارویی، دوره: 4، شماره: 2
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 68
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JMPBZ-4-2_008
تاریخ نمایه سازی: 27 آبان 1402
چکیده مقاله:
زعفران امروزه به عنوان یک گیاه استراتژیک در کشاورزی محسوب میشود. این گیاه به عنوان گرانترین ادویه جهان شناخته می شود و علاوه بر خواص مختلف خوراکی از دیرباز در طب سنتی مورد استفاده قرار گرفته است. یکی از مهم ترین خواص دارویی زعفران برای جلوگیری و درمان سرطان است. در این مطالعه ابتدا داده های ترانسکریپتوم از سایت NCBI Short read archive دانلود شدند. داده ها شامل پنج بافت کلاله، گلبرگ، برگ، پیاز و پرچم بودند. کنترل کیفی داده ها توسط نرم افزار FastQC و Trimmomatic انجام شده و بعد از آن اسمبلی خوانش ها صورت گرفت. پیش بینی ژنها توسط نرم افزار Trinity صورت گرفت. بیان ژنها با استفاده از نرم افزار RSEM سنجیده شده و با استفاده از دادهای موجود در مقالات ژنهای ضد سرطان در مسیر بیوسنتز فنیل پروپانویید با استفاده از مشابهت توالی های میان آن ها و ژنهای ساخته شده توسط Trinity با نرم افزار BLASTx مورد بررسی قرار گرفتند. از میان ژنهای موجود در مسیر بیوسنتز فنیل پروپانویید در این مطالعه، برای اولین بار ژن CAD۱ که کد کننده آنزیم Cinnamaldhyde است، شناسایی شد، این آنزیم در مسیرهای مختلف باعث جلوگیری از سرطان یا فعالیت تومور زایی می شود. در بررسی بیان این ژن مشخص شد که این ژن بیشترین بیان را در بافت های گلبرگ و کلاله دارد و کلاله این گیاه علاوه بر خواص ادویه آن می تواند به عنوان یک داروی ضد سرطان هم استفاده شود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محبوبه دهقان
گروه بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده علوم و فناوری های زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
مسعود توحید فر
گروه بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده علوم و فناوری های زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران