ارزیابی تنوع ژنتیکی و گروه بندی اکوتیپ های مختلف هندوانه با استفاده از نشانگرهای مولکولی SRAP

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 81

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_NBR-4-3_001

تاریخ نمایه سازی: 8 آذر 1402

چکیده مقاله:

تعداد ۳۸ توده و رقم مهم هندوانه از مناطق مختلف کشور جمع­ آوری و پس ­از آماده­ سازی خاک، در مزرعه تحقیقاتی در قالب طرح بلوک­ های کامل تصادفی با سه تکرار کشت شد. به­ منظور بررسی تنوع ژنتیکی، DNA از برگ استخراج و واکنش زنجیره­ای پلیمراز با استفاده از ۱۴ جفت آغازگر SRAP بهینه شد. تعداد ۱۳۶ باند چندشکل به ­دست آمد، که جفت آغازگر EM۱۰-Me۴ با تعداد نوزده باند و جفت آغازگرهایEM۱۶-Me۴  و EM۱۶-Me۴ با تعداد هفت باند به ­ترتیب بیشترین و کمترین تعداد باند چندشکل را ایجاد کردند. محتوای اطلاعات چندشکل (PIC) در این تحقیق بین ۲۰/۰ تا ۳۲/۰ و میزان تنوع ژنی براساس شاخص نی از ۱۷/۰ تا ۲۸/۰ به ­دست آمد. تجزیه تابع تشخیص خطی فیشر نشان داد که روش UPGMA و با انجام صحت گروه­بندی در حدود ۹۰ درصد، مناسب­تر از دیگر روش­ های تجزیه خوشه­ ای است. تجزیه خوشه ­ای  براساس روش جاکارد توده ­های تحت مطالعه را در پنج گروه مجزا قرار داد. تجزیه به مختصات اصلی نشان  می­دهد که مولفه­ های اول و دوم ۵/۹۲ درصد از تنوع به­ دست ­آمده را توجیه می­ کنند که خود نشان ­دهنده توزیع مناسب نشانگرها در کل ژنوم است.

نویسندگان

Maryam Abdoli Nasab

Graduate University of Advanced Technology, Kerman,

Mehdi Rahimi

Graduate University of Advanced Technology, Kerman,

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Brickell, C. ۱۹۹۲. The Royal Horticultural Society Encyclopedia of Gardening. ...
  • Dane, F. and Liu, J. ۲۰۰۷. Diversity and origin of ...
  • Ferriol, M., Pico, B., Cordova, P. and Nuez, F. ۲۰۰۴. ...
  • Gama, R., Santos, C.F., Dias, R. and Souza, F. ۲۰۱۳. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۸. The application of DNA markers in plant ...
  • Jeffrey, C. ۲۰۰۱. Cucurbitaceae. In: Hanelt P. (ed.), Mansfeld's encyclopedia ...
  • Lavi, U., Cregan, P. Schaap, T., and Hillel, J. ۱۹۹۴. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۸. The application of DNA markers in plant ...
  • Gvozdanovic-Varga, J., Vasic, M., Milic, D. and Cerv-enski, J. ۲۰۱۱. ...
  • Ipek Uluturk, Z., Frary, A. and Doganlar, S. ۲۰۱۱. Determination ...
  • Levi, A. and Thomas, C.E. ۲۰۰۱. Low genetic diversity indicates ...
  • Li, G., and Quiros, C.F. ۲۰۰۱. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), ...
  • Lincoln, S.E., Daly, M.J. and Lander, E.S. ۱۹۹۳. Constructing genetic ...
  • Liu, K. and Muse, S.V. ۲۰۰۵. PowerMarker: an integrated analysis ...
  • Mujaju, C., Sehic, J., Werlemark, G., Garkava-Gustavsson, L., Fatih, M. ...
  • NarouiRad, M., AllahDo, M., Ghasemi, A. and Fanaei, H. ۲۰۰۹. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۲. Genetic distance between populations. – Am. Nat. ...
  • Neuhausen, S.L. ۱۹۹۲. Evaluation of restriction fragment length polymorphism in ...
  • Oms-Oliu, G., Odriozola-Serrano, I., Soliva-Fortuny, R. and Martin-Belloso, O. ۲۰۰۵. ...
  • Raghami, M., Hasandokht, M., Fatahi-Moghadam, M., Kashi, A. and López-Sesé, ...
  • Robertson, H. ۲۰۰۴. Citrullus lanatus (Watermelon, Tsamma). – Museums Online ...
  • Sheng, Y., Luan, F., Zhang, F. and Davis, A.R. ۲۰۱۲. ...
  • Zhu, J., Gale, M.D., and Guarrie, S. ۱۹۹۸. AFLP markers ...
  • Brickell, C. ۱۹۹۲. The Royal Horticultural Society Encyclopedia of Gardening. ...
  • Dane, F. and Liu, J. ۲۰۰۷. Diversity and origin of ...
  • Ferriol, M., Pico, B., Cordova, P. and Nuez, F. ۲۰۰۴. ...
  • Gama, R., Santos, C.F., Dias, R. and Souza, F. ۲۰۱۳. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۸. The application of DNA markers in plant ...
  • Jeffrey, C. ۲۰۰۱. Cucurbitaceae. In: Hanelt P. (ed.), Mansfeld's encyclopedia ...
  • Lavi, U., Cregan, P. Schaap, T., and Hillel, J. ۱۹۹۴. ...
  • Ghareyazi, B. ۱۹۹۸. The application of DNA markers in plant ...
  • Gvozdanovic-Varga, J., Vasic, M., Milic, D. and Cerv-enski, J. ۲۰۱۱. ...
  • Ipek Uluturk, Z., Frary, A. and Doganlar, S. ۲۰۱۱. Determination ...
  • Levi, A. and Thomas, C.E. ۲۰۰۱. Low genetic diversity indicates ...
  • Li, G., and Quiros, C.F. ۲۰۰۱. Sequence-related amplified polymorphism (SRAP), ...
  • Lincoln, S.E., Daly, M.J. and Lander, E.S. ۱۹۹۳. Constructing genetic ...
  • Liu, K. and Muse, S.V. ۲۰۰۵. PowerMarker: an integrated analysis ...
  • Mujaju, C., Sehic, J., Werlemark, G., Garkava-Gustavsson, L., Fatih, M. ...
  • NarouiRad, M., AllahDo, M., Ghasemi, A. and Fanaei, H. ۲۰۰۹. ...
  • Nei, M. ۱۹۷۲. Genetic distance between populations. – Am. Nat. ...
  • Neuhausen, S.L. ۱۹۹۲. Evaluation of restriction fragment length polymorphism in ...
  • Oms-Oliu, G., Odriozola-Serrano, I., Soliva-Fortuny, R. and Martin-Belloso, O. ۲۰۰۵. ...
  • Raghami, M., Hasandokht, M., Fatahi-Moghadam, M., Kashi, A. and López-Sesé, ...
  • Robertson, H. ۲۰۰۴. Citrullus lanatus (Watermelon, Tsamma). – Museums Online ...
  • Sheng, Y., Luan, F., Zhang, F. and Davis, A.R. ۲۰۱۲. ...
  • Zhu, J., Gale, M.D., and Guarrie, S. ۱۹۹۸. AFLP markers ...
  • نمایش کامل مراجع