Graph Feature Selection for Anti-Cancer Plant Recommendation

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 72

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_COAM-8-2_001

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1402

چکیده مقاله:

Every year‎, ‎extensive experimental analysis is conducted to evaluate the anti-cancer properties of plants‎. ‎Developing a well-ranked list of potential anti-cancer plants based on verified anti-cancer metabolites can significantly reduce the time and cost required for plant evaluation‎. This paper proposes a method for generating such a ranked list by analyzing biological graphs of plant-metabolite interactions‎. ‎In this approach‎, ‎graph nodes are ranked based on specific graph features‎. ‎However‎, ‎a challenge arises in selecting the most informative graph features that ensure the resulting ranked plant list is more relevant‎, ‎prioritizing plants with greater anti-cancer properties at the top‎. ‎To address this challenge‎, ‎we propose the use of the Average Precision metric commonly used in information retrieval and recommender systems‎, ‎to compare different ranked lists‎. By constructing a network that captures the similarities between plants based on their shared metabolites‎, ‎and ranking plants using different combinations of graph features‎, ‎we can identify the subset of features that yields a ranked list with a higher Average Precision score‎. ‎This subset of features can then be considered the most suitable for recommending anti-cancer plants‎. ‎ The proposed method can be used to select the best graph features for screening unverified plant lists for anti-cancer properties‎, ‎increasing the likelihood of identifying plants with higher scores in the list that possess anti-cancer properties‎.

نویسندگان

Mahmood Amintoosi

‎Department of Computer Science‎, ‎Hakim Sabzevari University‎, ‎Sabzevar‎, ‎Iran.

Eisa Kohan-Baghkheirati

‎Department of Biology‎, ‎Hakim Sabzevari University‎, ‎Sabzevar‎, ‎Iran‎.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abeesh, P., Guruvayoorappan, C. (۲۰۲۲). “Preparation and characterization of beta ...
  • Ahmed, M.M., Tazyeen, S., Ali, R., Alam, A., Imam, N., ...
  • Allenspach, M., Steuer, C. (۲۰۲۱). “α-Pinene: A never-ending story”, Phytochemistry, ...
  • Amadea, I.C., Atrasina, D. (۲۰۲۱). “The effects of simvastatin and ...
  • Behl, S., Inbanathan, A., Sundaram, M.K., Hussain, A. (۲۰۲۲). “Plants ...
  • Bouyahya, A., El Allam, A., Zeouk, I., Taha, D., Zengin, ...
  • Craswell, N., Robertson, S. (۲۰۰۹). “Average Precision at n”, In ...
  • El-Beltagy, A. E.-F.B., Elsyyad, H.I., Abdelaziz, K.K., Madany, A.S., Elghazaly, ...
  • Gopalakrishnan, S., Sridharan, S., Nayak, S.R., Nayak, J., Venkataraman, S. ...
  • Hasanzadeh, M., Movahedi, M., Rejali, M., Maleki, F., Moetamani-Ahmadi, M., ...
  • Kaur, J., Mahey, S., Ahluwalia, P., Joshi, R., Kumar, R. ...
  • Khan, M.I., Bouyahya, A., Hachlafi, N.E., Menyiy, N.E., Akram, M., ...
  • Kim, S., Thiessen, P.A., Bolton, E.E., Chen, J., Fu, G., ...
  • Ma, X., Yu, X., Min, J., Chen, X., Liu, R., ...
  • Ma, Y., Guo, J., Li, D., Cai, X. (۲۰۲۲b). “Identification ...
  • Naseri, A., Sharghi, M., Hasheminejad, S.M.H. (۲۰۲۱). “Enhancing gene regulatory ...
  • Naujokat, C., McKee, D.L. (۲۰۲۱). “The “Big Five” phytochemicals targeting ...
  • Pagare, S., Bhatia, M., Tripathi, N., Pagare, S., Bansal, Y.K. ...
  • Pavlopoulos, G.A., Hooper, S.D., Sifrim, A., Schneider, R., Aerts, J. ...
  • Rajavel, T., Mohankumar, R., Archunan, G., Ruckmani, K., Devi, K.P. ...
  • Rawat, B., Dwivedi, S.K. (۲۰۱۹). “Selecting appropriate metrics for evaluation ...
  • Rezayi, M., Farjami, Z., Hosseini, Z.S., Ebrahimi, N., Abouzari-Lotf, E. ...
  • Shinbo, Y., Nakamura, Y., Altaf-Ul-Amin, M., Asahi, H., Kurokawa, K., ...
  • Sohel, M., Biswas, P., AlAmin, M., Hossain, M.A., Sultana, H., ...
  • Sung, H., Ferlay, J., Siegel, R.L., Laversanne, M., Soerjomataram, I., ...
  • Zhang, E., Zhang, Y. (۲۰۰۹). “Average precision”, In Liu, L. ...
  • نمایش کامل مراجع