طراحی و ارزیابی بیوانفورماتیکی پروتئین مولتی اپی توپ جهت تشخیص عفونت استرونژیلوئیدازیس

سابقه و هدف: تشخیص سرولوژیکی (S. stercoralis) Strongyloides stercoralis به دلیل واکنش متقابل با سایر نماتدهای انگلی اغلب چالش برانگیز است. بنابراین، لازم است برای تشخیص صحیح این عفونت انگلی نادیده گرفته شده از طریق سیستم گوارش وارد شده و حتی می تواند بر نازایی هم موثر باشد، آزمایش های سرولوژیکی جدید با کارایی بالا معرفی شوند. این مطالعه با هدف، طراحی یک ساختار چند اپی توپی برای تشخیص S. stercoralis انجام پذیرفت. مواد و روش ها: مطالعه حاضر یک مطالعه ایمونوانفورماتیک محاسباتی می باشد. برای هدف این مطالعه، ابتدا بخش های بسیار آنتی ژنیک و اپی توپ های بالقوه ایمنی غالب S. stercoralis از دو پروتئین آنتی ژنیک شناسایی شدند و سپس تمام قسمت های انتخاب شده توسط یک پیونددهنده مناسب به هم متصل شدند. در ادامه، ویژگی های فیزیکوشیمیایی سازه طراحی شده مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. سپس سازه های ثالثی سازه ساخته و مورد ارزیابی قرار گرفتند تا بهترین آن ها مشخص شود. یافته ها: ارزیابی بیوانفورماتیک نشان داد که ساختار پروتئینی طراحی شده می تواند آبدوست، پایدار در برابر حرارت و اسیدی باشد. هم چنین مدل سه بعدی ساخته شده مشابه ساختار پروتئین های طبیعی بود. استنتاج: با توجه به نتایج مطالعه، سازه طراحی شده می تواند به عنوان یک آنتی ژن کارآمد در سیستم ELISA برای تشخیص سرولوژیک استرونژیلوئیدیازیس انسانی مورد استفاده قرار گیرد.