A reverse transcriptase-loop mediated isothermal amplification assay (RT-LAMP) for rapid detection of bovine viral diarrhea virus ۱ and ۲

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 78

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARCHRAZI-72-2_001

تاریخ نمایه سازی: 6 دی 1402

چکیده مقاله:

Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a pathogen that infects cattle, and is globally important. It causes substantial financial losses to the livestock industry. In the current study, a one-step reverse transcriptase-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay was set up for rapid and efficient detection of BVDV. For this purpose, four primers were designed to recognize six distinct regions on the target RNA based on a highly conserved sequence in the ۵΄ UTR of the BVDV genome. Eighty blood specimens were collected from bovines suspected to suffer from BVDV infection, and were tested in parallel by RT-LAMP and RT-PCR. Twenty four of these samples were positive by RT-LAMP, while twenty were positive by RT-PCR. The RT-LAMP detection limit was estimated to be approximately ۷۰PFU /mL of virus. Comparison of RT-PCR with RT-LAMP in this study revealed the recent developed RT-LAMP a highly sensitive and specific for BVD virus detection in the clinical samples.

کلیدواژه ها:

Bovine viral diarrhea ، Reverse Transcriptase-Loop mediated isothermal amplification assay ، Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction

نویسندگان

Amir Tajbakhsh

Department of Biology, Faculty of Science, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran

Elham Rezatofighi

Department of Biology, Faculty of Science, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran

Khalil Mirzadeh

Department of Animal Science and Food, Khouzastan Ramin Agriculture and Natural Resources University, Ahvaz, Iran

Mahdi Pourmahdi

Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Baker, J.C., ۱۹۹۵. The Clinical Manifestations of Bovine Viral Diarrhea ...
  • Brownlie, J., ۱۹۸۵. Clinical aspects of the bovine virus diarrhoea ...
  • Brownlie, J., Hooper, L.B., Thompson, I., Collins, M.E., ۱۹۹۸. Maternal ...
  • Carman, S., van Dreumel, T., Ridpath, J., Hazlett, M., Alves, ...
  • Chen, H.T., Zhang, J., Liu, Y.S., Liu, X.T., ۲۰۱۱. Detection ...
  • Edwards, S., ۱۹۹۰. The diagnosis of bovine virus diarrhoea-mucosal disease ...
  • Fan, Q., Xie, Z., Xie, L., Liu, J., Pang, Y., ...
  • Fulton, R.W., d'Offay, J.M., Saliki, J.T., Burge, L.J., Helman, R.G., ...
  • Gamlen, T., Richards, K.H., Mankouri, J., Hudson, L., McCauley, J., ...
  • Hamel, A.L., Wasylyshen, M.D., Nayar, G.P., ۱۹۹۵. Rapid detection of ...
  • Horner, G.W., Tham, K.-M., Orr, D., Ralston, J., Rowe, S., ...
  • Houe, H., ۱۹۹۹. Epidemiological features and economicalimportance of bovine virus ...
  • Jiang, T., Liu, J., Deng, Y.Q., Xu, L.J., Li, X.F., ...
  • Katz, J.B., Hanson, S.K., ۱۹۸۷. Competitive and blocking enzyme-linked immunoassay ...
  • Lanyon, S.R., Hill, F.I., Reichel, M.P., Brownlie, J., ۲۰۱۴. Bovine ...
  • Moennig, V., Liess, B., ۱۹۹۵. Pathogenesis of intrauterine infections with ...
  • Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., ...
  • OIE, ۲۰۰۸. Bovine viral diarrhoea Terrestrial Manual, World Organization for ...
  • Paton, D.J., Ibata, G., Edwards, S., Wensvoort, G., ۱۹۹۱. An ...
  • Rovira, A., Abrahante, J., Murtaugh, M., Munoz-Zanzi, C., ۲۰۰۹. Reverse ...
  • Saliki, J.T., Fulton, R.W., Hull, S.R., Dubovi, E.J., ۱۹۹۷. Microtiter ...
  • Schmitt, B.J., Lopez, O.J., Ridpath, J.F., Galeota-Wheeler, J., Osorio, F.A., ...
  • Shi, W., Li, K., Ji, Y., Jiang, Q., Shi, M., ...
  • Shirvani, E., Lotfi, M., Kamalzadeh, M., Noaman, V., Bahriari, M., ...
  • Talebkhan Garoussi, M., Haghparast, A., Hajenejad, M.R., ۲۰۰۹. Prevalence of ...
  • Vilcek, S., Herri ng, A.J., Herring, J.A., Nettleton, P.F., Lowings, ...
  • Vilcek, S., Paton, D.J., Durkovic, B., Strojny, L., Ibata, G., ...
  • Yang, J.L., Zhang, S.H., Liu, Z.H., Yang, R., Huang, Y.,Wen, ...
  • Zhang, N., Liu, Z., Han, Q., Qiu, J., Chen, J., ...
  • Zhang, S.Q., Tan, B., Li, P., Wang, F.X., Guo, L., ...
  • نمایش کامل مراجع