ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

آنالیز شبکه برهمکنش پروتئین - پروتئین بر اساس ژن های تغییر بیان یافته در بافت ریه برای بیماری آنفولانزای مرغی

محل انتشار: فصلنامه تحقیقات دامپزشکی و فرآورده های بیولوژیک، دوره: 36، شماره: 4
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 84

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1873320

شناسه ملی سند علمی:

JR_VTJ-36-4_008

تاریخ نمایه سازی: 11 دی 1402

چکیده مقاله:

شیوع بیماری آنفولانزای پرندگان با مرگ و میر بالا، کاهش تولید تخم و کشتن اجباری گله های آلوده، تاثیر مخربی بر صنعت طیور دارد. براساس پروتئین مرکزی ویروس به سه زیر گروه A,B,C تقسیم می شود. ویروس آنفولانزای نوع A بسیار شایع می باشد این ویروس می تواند باعث ابتلای گونه های مختلف پستانداران و پرندگان شود و بیماری زایی بیشتری نسبت به آنفولانزای ,B,C دارد و تقریبا همه ساله باعث اپیدمی با شدت های مختلف می شود. اهداف اصلاح نژادی برای حفظ سلامت حیوانات منجر به رفاه حیوانات و جلوگیری از ضررهای اقصادی می شود. هدف از پژوهش حاضر، استفاده از روش آنالیز شبکه زیستی به منظور شناسایی نشانگرهای کلیدی جدید درگیر در بیماری آنفولانزای مرغی می باشد. در این مطالعه به منظور دستیابی سریع به مهم ترین ژن های درگیر در این بیماری داده های ریزآرایه بیان ژن مربوط به بافت ریه جوجه های آلوده به ویروس از سایت GEO با شماره دسترسی GSE۵۳۹۳۱ تهیه گردید. رسم شبکه برهمکنش پروتئین-پروتئین توسط نرم افزار Cytoscape انجام شد. آنالیز کمپلکس های پروتئینی به کمک MCODE انجام گردید. سه کمپلکس پروتئینی استخراج شد. پروتئین های seed در کمپلکس ها عبارتند از RPL۱۰A, NOB۱, MSH۴ که بعنوان نشانگر کلیدی معرفی شدند، همچنین ژن های NEB، RPF۱، CSRNP۱، RNF۱۴۶، RPL۱۸A با کم ترین درجه بیان و ژن های SLC۶A۲۰، PLN ،SLC۱۷A۸، NOXO۱، TMEM۱۷۹ با بیشترین درجه بیان در مطالعه حاضر می باشند. بیشتر ژن ها در رونویسی، تکثیر، ترجمه ژن در ویروس آنفولانزا نقش دارند. آنالیزهای بر پایه شبکه می تواند به تشخیص ژن های درگیر در بیماری و ماژول عملکردی بپردازد، که این امر می تواند کمک قابل توجهی در شناسایی عوامل تنظیم کننده و فرآیندهای زیستی دخیل در پاسخ به بیماری آنفولانزای مرغی داشته باشد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

آزاده ترابی

استادیار موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات،آموزش و ترویج کشاورزی،ایران،کرج

زهرا رودباری

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Arnold, U. ۲۰۱۸. Investigations into the cellular interactome of the ...
  • Bader, G. D. and Hogue, C. W. ۲۰۰۳. An automated ...
  • Cameron, C. M., Cameron, M. J., Bermejo-Martin, J. F., Ran, ...
  • Cui, Morgan, D., Cheng, D. H., Foo, S. L., Yap, ...
  • Forero, A., Tisoncik, J., Watanabe, T., Zhong, G., Hatta, M., ...
  • Green, R., Wilkins, C., Thomas, S., Sekine, A., Hendrick, D. ...
  • Heaton, N. S., Moshkina, N., Fenouil, R., Gardner, T. J., ...
  • Hu, J., Mo, Y., Wang, X., Gu, M., Hu, Z., ...
  • Hu, Y., Lou, J., Mao, Y. Y., Lai, T. W., ...
  • Huang, D. W., Sherman, B. T. and Lempicki, R. A. ...
  • James, S., Ola, B., Terrence, M.T., Jeffery, K.T., James, C.P. ...
  • Kann, M. G. ۲۰۰۷ Protein interactions and disease: computational approaches ...
  • Khadimian, S., Bayat, M., Azizi, A., Qadri, S., Zia, M.A. ...
  • Klees, S., Schluter, J. S., Schellhom, J., Bertram, H., Kurzweg, ...
  • Liu, Y. C., Mok, B. W. Y., Wang, P., Kuo, ...
  • Mason, O. and Verwoerd, M. ۲۰۰۶. Graph Theory and Networks ...
  • Ouyang, H., Wang, Z., Chen, X., Yu, J., Li, Z., ...
  • Rahim, M., Klewes, L., Zahedi, A., Mai, S. and Coombs, ...
  • Ramnani, B., Manivannan, P., Jaggernauth, S., and Malathi, K. ۲۰۲۱. ...
  • Ranaware, P. B., Mishra, A., Vijayakumar, P., Gandhale, P. N., ...
  • Rashid, M. ۲۰۲۲. Role of fibronectin-interacting cellular proteins in Influenza ...
  • Rual, J. F., Venkatesan, K., Hao, T., Hirozane-Kishikawa, T., Dricot, ...
  • Shahsundi, sh. ۲۰۱۴. Dynamic evaluation of influenza virus multiplication and ...
  • Shannon, P., Markiel, A., Ozier, O., Baliga, N. S., Wang, ...
  • Spackman, E. ۲۰۰۲. Influenza virus and the avian H۵ and ...
  • Sun, W., Li, S., Yang, J., Yang, L., Quan, G. ...
  • Tatebe, K., Zeytun, A., Ribeiro, R. M., Hoffman, R., Harrod, ...
  • Ulyanova, V., Shah Mahmud, R., Laikov, A., Dudkina, E., Markelova, ...
  • Vanderven, H. A., Petkau, K., Ryan-Jean, K. E., Aldridge Jr, ...
  • Wahl, A.,Schafer, F., Bardet, W. and Hildebrand, W. H. ۲۰۱۰. ...
  • Yang, J., Huang, X., Liu, Y., Zhao, D., Han, K., ...
  • Ye, Y,. Fan, H., Li, Q., Zhang, Z., Miao, P., ...
  • Yildirim, M. A., Goh, K. I., Cusick, M. E., and ...
    • نمایش کامل مراجع