ردیابی نشانه های انتخاب مثبت مرتبط با صفات مهم اقتصادی در نژادهای گوسفند ایرانی (زندی) و مصری (بارکی و راهمنی) با استفاده از روش hapFLK
محل انتشار: مجله تحقیقات تولیدات دامی، دوره: 12، شماره: 3
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 55
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-12-3_006
تاریخ نمایه سازی: 18 دی 1402
چکیده مقاله:
انتخاب طبیعی و مصنوعی در جهت افزایش فراوانی جهشهای جدیدی که در برخی از جمعیتها مفید هستند باعث بر جای گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشود. هدف از پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب بین نژادهای گوسفند بومی ایران با نژادهای مصری بود. بدین منظور از اطلاعات ۹۶ راس گوسفند زندی و ۱۰۷ راس گوسفند مصری (۵۹ راس بارکی و ۴۸ راس راهمنی) استفاده شد. پس از اجرای مراحل مختلف کنترل کیفیت دادهها، برای شناسایی نشانههای انتخاب از روش آماری hapFLK به وسیله نرمافزارhapFLK نسخه ۴/۱ استفاده شد. ژنهای کاندیدا با استفاده از چندشکلیهای تک نوکئوتیدی (SNP) که در بازه ۱/۰ درصد بالای ارزش hapFLK، واقع شده بودند با استفاده از برنامه BioMart شناسایی شدند. سپس عملکرد زیستی ژنها با استفاده از پایگاه اطلاعاتی PANTHER بررسی شده و برای تفسیر عملکرد ژنهای کاندیدا از پایگاههای برخط GeneCards و UniProtKB استفاده شد. نتایج حاصل از hapFLK نشان داد که در مقایسه جمعیت گوسفند بومی زندی با نژادهای مصر،ی هفت ناحیه ژنومی روی کروموزومهای یک، دو (سه منطقه)، ۱۰، ۲۵ و ۲۶ شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای DNAJB۴، FNDC۳B، GULP۱، ACVR۱ و FGF۹ قرار داشتند. ژنهای موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، سازگاری، تعداد بره متولد شده و رشد عضلات مرتبط هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات در نژادهای مختلف گوسفند فراهم آورد. به هر حال، جهت شناسایی دقیق این ژنها و جایگاههای کنترل کننده صفات کمی یا QTLها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
حسین محمدی
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک
حسین مرادی شهربابک
استادیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران
امیر حسین خلت آبادی فراهانی
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :