کاربرد بارکدگذاری DNA توسط مارکر ریبوزومی ITS در شناسایی و طبقه بندی مولکولی قارچ های اکتومیکوریز
محل انتشار: نشریه طبیعت ایران، دوره: 3، شماره: 2
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 33
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IRNAT-3-2_005
تاریخ نمایه سازی: 29 دی 1402
چکیده مقاله:
همزیستی اکتومیکوریزایی، همزیستی گسترده میان قارچ های خاکزی و ریشه های درختان جنگلی می باشد که در استقرار و عملکرد گیاهان در اکوسیستم های جنگلی نقش مهمی ایفا می کند. شناسایی قارچهای اکتومیکوریز، گام نخست تمام مطالعات مرتبط با این همزیستی بوده و برای بهره برداری از حداکثر پتانسیل آن در مدیریت جنگل امری ضروریست. در دهه اخیر، تکنیکهای مولکولی آنالیز DNA برای حل چالشهای تاکسونومی مرتبط با شناسایی قارچهای اکتومیکوریز در سطح نوک ریشههای به دست آمده از عرصه، بخصوص وقتی دادههای ریخت شناسی متمایزکننده نبوده، استفاده شده است. تحقیق حاضر با هدف معرفی و تایید کارآیی آنالیزهای مولکولی DNA و مطالعات فیلوژنی در شناسایی قارچ های اکتومیکوریز درختان بلوط (Quercus sp.) در جنگل های شمال کشور اجرا شد. در بازدید از این جنگلها، نوک ریشه های اکتومیکوریزایی درختان بلوط جمع آوری و برای شناسایی مولکولی قارچها ناحیه ITS۱-۵.۸S-ITS۲ با آغازگرهای گونه های قارچی، تکثیر و تعیین توالی شد. سپس تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی آنها به همراه توالی های موجود در پایگاههای معتبر با روش بیس (Bayesian method) صورت گرفت که نتیجه آن شناسایی ۴۹ تاکسون مختلف از قارچهای اکتومیکوریز متعلق به ۱۳ جنس بود. این بررسی نشان داد جمعیت متنوعی از قارچهای اکتومیکوریز در جنگلهای هیرکانی همراه درختان بلوط وجود دارد و استفاده از توالی ناحیه ITS rDNA ابزاری دقیق و ارزشمند جهت شناسایی این قارچها در عرصههای جنگلی ایران است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سیده معصومه زمانی
دانش آموخته دکترا، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس و پژوهشگر موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
ناصر زمانی
دانشیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
ابراهیم محمدی گل تپه
استاد، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
محمدرضا عارفی پور
پژوهشگر، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :