افزایش جذب فلورسانس آنزیم ایزو پنتنیل دی فسفات ایزومراز با استفاده از جهش نقطه‌ای و بهبود fluorescence detection آن

ایزو پنتنیل دی فسفات ایزومراز آنزیمی است که تبدیل فرم غیر فعال ایزو پنتنیل پیرو فسفات به فرم فعال دی متیل الیل پیرو فسفات را انجام می‌دهد.از آنجاییکه این مسیر آنزیمی نقش اساسی در حیات و بقاء باکتری دارد، لذا با مهار عملکرد این آنزیم میتوان از رشد و گسترش باکتریهای مضرو بیماری‌زا جلوگیری کرد.با توجه به عملکرد اساسی تیروزین 104 در اتصال لیگاند به آنزیم، با استفاده از تکنیکfluorescence detection می توان قابلیت اتصال مهار کنندههای مختلف را بررسی نمود. از سوی دیگر میزان جذب فلورسانس این آمینو اسید پایین می باشد، لذا در این پروژه با ایجاد جهش نقطهای در آنزیم، میزان تغییر درجذب نور فلورسانس آن بررسی شد. بررسیهای بیوانفورماتیک نشان داد با ایجاد جهش نقطهای و جایگزینی آمینو اسید تریپتوفان به جای تیروزین 104 درآنزیم ipp، نه تنها ساختار طبیعی آن تغییر نکرده است، بلکه تمایل اتصال آنزیم به لیگاند نیز افزایش یافته است. لذا می‌توان از این شیوه به منظور بهبود fluorescence detection در بررسی اتصال پروتیین به لیگاند و آنالوگ‌های مهاری آن استفاده نمود.