بررسی بیوانفورماتیکی اثر miRNAs بر بیان ژن های دخیل در فرآیند نورون-زایی در مغز ماهی گورخری (Danio rerio)

microRNAهای (miRNA) مختلفی در فرآیند تمایز سلول­های عصبی و نورون­زایی در مغز مهره­داران نقش دارند، اما بررسی­های انجام شده بر miRNAهای در ماهیان و تعیین ژن­های هدف آن ها بسیار محدود است. ریزآرایه به عنوان یک روش استاندارد برای مطالعه کلی ژن­های تحت کنترل miRNA ها است. اما هزینه بسیار زیاد این روش، استفاده از آن را در بسیاری از مواقع محدود کرده است. این در حالی است که با پیشرفت الگوریتم بیوانفورماتیکی و مدل­سازی کامپیوتری می­توان اهداف mRNA را برای miRNA پیش­بینی کرد. از این رو، در مطالعه حاضر تلاش شده است تا از طریق بررسی بیوانفورماتیک ژن­ها و miRNAهای دخیل در تنظیم ژن­های فعال در تمایز سلول­های عصبی و نورون­زایی در مغز ماهی گورخری، با استفاده از نرم­افزارهای پایگاه­های Target Scan و DIANA ژن­ها و miRNAهای مربوطه شناسایی شود. نتایج بررسی­های بیوانفورماتیکی انجام شده نشان داد که بیان ژن­های neurod۶b، neurod۲، neurod۴، olfm۱a و olfm۱b، gle۱، sox۱۱a و sox۱۱b، cadm۱b، notch۲ و notch۱b با بیشترین احتمال ممکن است در مسیر نورون زایی تحت تاثیر dre-miRNAs قرار گیرند. از این رو به نظر می­رسد که محصول این ژن­ها می­تواند به عنوان کاندیدای مناسب جدیدی برای بررسی­های تجربی شناخت مسیر نورون­زایی در مغز ماهی گورخری در نظر گرفته شود.