شناسایی چندین توالی های کدکننده پروتئین فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-sequencing

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 10

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-12-2_005

تاریخ نمایه سازی: 28 اسفند 1402

چکیده مقاله:

عقرب Hemoscorpius lepturus کشنده ترین عقرب ایران است و به همین جهت از نظر پزشکی اهمیت زیادی دارد. علائم بالینی ناشی از مسمومیت با زهر عقرب H. lepturus، مانند اثرات سمی نروتوکسیسیتی، سوزشهای پوستی و همچنین برخی از واکنشهای التهابی به فعالیت فسفولیپاز A۲ آن نسبت داده شده است. هدف این مطالعه شناسایی و دسته بندی ژن های کدکننده فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب H. lepturus است. به همین منظور در این مطالعه، یک کتابخانه cDNA از غدد سم این عقرب با استفاده از تکنیک توالی یابی RNA ایلومینا تولید شد. توالی های کد کننده PLA۲ با استفاده از ابزار اصلی جستجوی تراز محلی (BLAST) و جستجوهای تشابه بین داده های خام غده زهر با توالی های ثبت شده از بندپایان دیگر به ویژه عقرب C. sculpturatus شناسایی و استخراج شدند. این جستجوها منجر به یافتن چندین همولوگ از PLA۲ در غدد زهر این عقرب با شباهت توالی به فاکتور فعال کننده پلاکت استیل هیدرولاز (PAFA)، PLA۲ های وابسته به کلسیم (cPLA۲)، PLA۲ های ترشح شونده (sPLA۲)، PLA۲ های مستقل از کلسیم (iPLA۲) و گروه III هترودیمریک فسفولیپاز A۲ (hgPLA۲) شد. اغلب توالی های یافت شده بیشترین شباهت را با توالی های PLA۲ از عقرب های C. sculpturatus و Androctonus crassicauda نشان دادند. این اولین گزارش از شناسایی، دسته بندی و تعیین خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی های PLA۲ است که در آن روابط فیلوژنتیکی بین بندپایان مختلف با استفاده از توالی های شناسایی شده بررسی شد.

نویسندگان

فاطمه ثعلبی

Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO)